More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3644 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3644  type I restriction enzyme R protein N terminus (HSDR_N)/N-6 DNA methylase  100 
 
 		 866 aa  1788    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1457  type I restriction-modification system, M subunit, putative  26.79 
 
 		 684 aa  147  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.57 
 
 		 654 aa  141  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  27.41 
 
 		 707 aa  141  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  28.16 
 
 		 605 aa  138  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  27.95 
 
 		 657 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  26.77 
 
 		 478 aa  124  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  26.46 
 
 		 477 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1224  N-6 DNA methylase  23.6 
 
 		 796 aa  120  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.708606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  26.95 
 
 		 481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0689  DNA methylase-type I restriction-modification system  25.91 
 
 		 687 aa  117  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  29.08 
 
 		 489 aa  111  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  27.18 
 
 		 553 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  29.85 
 
 		 480 aa  107  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0921  N-6 DNA methylase  26.09 
 
 		 676 aa  106  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  25.07 
 
 		 553 aa  106  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  31.15 
 
 		 703 aa  105  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  24.39 
 
 		 579 aa  105  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  29.17 
 
 		 509 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3269  type I restriction-modification system specificity subunit  25.86 
 
 		 498 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.266741  normal  0.0966647 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  22.94 
 
 		 730 aa  100  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  26.75 
 
 		 486 aa  100  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  26.46 
 
 		 748 aa  98.2  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  28.78 
 
 		 503 aa  97.8  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  23.96 
 
 		 554 aa  97.8  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  25.98 
 
 		 499 aa  97.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  29.18 
 
 		 506 aa  97.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  26.35 
 
 		 486 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  25.36 
 
 		 834 aa  95.5  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  25.19 
 
 		 489 aa  95.5  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  29.07 
 
 		 527 aa  95.5  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.88 
 
 		 484 aa  95.1  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  24.09 
 
 		 768 aa  95.1  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  26.73 
 
 		 494 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  30.66 
 
 		 429 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  26.38 
 
 		 570 aa  93.6  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  30.66 
 
 		 429 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  30.12 
 
 		 513 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  25.61 
 
 		 500 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  29.46 
 
 		 492 aa  92.4  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0972  N-6 DNA methylase  26.42 
 
 		 911 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91965 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  29.46 
 
 		 486 aa  91.3  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  23.98 
 
 		 488 aa  91.3  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  26.99 
 
 		 508 aa  90.9  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  22.25 
 
 		 505 aa  90.5  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  24.66 
 
 		 501 aa  90.1  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  31.02 
 
 		 484 aa  90.5  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  26.67 
 
 		 494 aa  90.1  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.32 
 
 		 530 aa  89.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5290  N-6 DNA methylase  23.24 
 
 		 668 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  24.28 
 
 		 489 aa  89  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1145  N-6 DNA methylase  22.2 
 
 		 628 aa  89.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  25.78 
 
 		 544 aa  88.6  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  27.73 
 
 		 822 aa  89  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  25.78 
 
 		 544 aa  88.2  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  25.49 
 
 		 484 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  27.68 
 
 		 500 aa  88.2  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0544  type I restriction-modification system, M subunit, putative  23.45 
 
 		 648 aa  88.2  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  29.11 
 
 		 534 aa  87.8  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.37 
 
 		 680 aa  87.8  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  30.57 
 
 		 524 aa  87.8  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  25.43 
 
 		 673 aa  87.8  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.64 
 
 		 533 aa  87.8  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  26.84 
 
 		 484 aa  87.4  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  25.9 
 
 		 540 aa  87.8  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3517  N-6 DNA methylase  25.13 
 
 		 486 aa  87.4  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  25.18 
 
 		 493 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  29.88 
 
 		 484 aa  87  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  29.88 
 
 		 484 aa  87.4  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  27.89 
 
 		 569 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  28.86 
 
 		 571 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  29.73 
 
 		 808 aa  87  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  24.82 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  27.87 
 
 		 710 aa  86.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  23.96 
 
 		 489 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  27.86 
 
 		 544 aa  86.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  26.3 
 
 		 545 aa  86.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  23.26 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  26.97 
 
 		 549 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  24.38 
 
 		 537 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  26.53 
 
 		 517 aa  85.5  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  26.12 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  28.21 
 
 		 775 aa  84.3  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0857  N-6 DNA methylase  26.89 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.015495  normal  0.121553 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  24.29 
 
 		 481 aa  84  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.07 
 
 		 548 aa  84  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  25.85 
 
 		 519 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  25.5 
 
 		 846 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  29.29 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  25.19 
 
 		 479 aa  83.2  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  30.74 
 
 		 512 aa  82.4  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  28.86 
 
 		 585 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1673  N-6 DNA methylase  24.23 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  25.61 
 
 		 676 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  25.61 
 
 		 676 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  26.54 
 
 		 824 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  23.78 
 
 		 513 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  24.69 
 
 		 539 aa  82.4  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  26.87 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  25.25 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>