More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2478 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2478  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 881 aa  1776    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  23.92 
 
 		 554 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  28.45 
 
 		 544 aa  91.3  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  30.14 
 
 		 503 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  27.98 
 
 		 544 aa  89  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  29.38 
 
 		 545 aa  87  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  25.88 
 
 		 605 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  24.27 
 
 		 484 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  26.61 
 
 		 553 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  27.62 
 
 		 544 aa  85.5  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1564  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.48 
 
 		 1134 aa  84.3  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  26.33 
 
 		 553 aa  84  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  28.01 
 
 		 508 aa  84  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  27.44 
 
 		 505 aa  83.2  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  25.73 
 
 		 814 aa  83.2  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  25.24 
 
 		 809 aa  82.8  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  26.91 
 
 		 527 aa  82.4  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  26.96 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  27.04 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  25.95 
 
 		 570 aa  82  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  29.17 
 
 		 827 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  26.57 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  27.3 
 
 		 499 aa  81.6  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  25.81 
 
 		 814 aa  81.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  26.35 
 
 		 808 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  25.15 
 
 		 579 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  31.05 
 
 		 539 aa  80.1  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  27.39 
 
 		 799 aa  79  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  25.66 
 
 		 871 aa  77  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1457  type I restriction-modification system, M subunit, putative  28.31 
 
 		 684 aa  77  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  24.32 
 
 		 513 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  25.46 
 
 		 571 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3269  type I restriction-modification system specificity subunit  26.42 
 
 		 498 aa  76.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.266741  normal  0.0966647 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  24.69 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  25 
 
 		 873 aa  75.1  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  25.18 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  26.84 
 
 		 810 aa  74.7  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.49 
 
 		 503 aa  73.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  26.22 
 
 		 847 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  24.76 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  26.69 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.29 
 
 		 502 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  24.75 
 
 		 513 aa  72.4  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  27.96 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  23.14 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  23.53 
 
 		 815 aa  72.4  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  27.86 
 
 		 493 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  24.27 
 
 		 810 aa  72  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  24.7 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  26.56 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  23.38 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  24.44 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  27.31 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  27.65 
 
 		 494 aa  70.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  23.81 
 
 		 481 aa  70.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  26.82 
 
 		 499 aa  70.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0084  N-6 DNA methylase  23.63 
 
 		 495 aa  70.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  23.3 
 
 		 429 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  23.35 
 
 		 824 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  25.9 
 
 		 512 aa  70.5  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  23.3 
 
 		 429 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  27.64 
 
 		 490 aa  70.1  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 498 aa  69.7  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  23.01 
 
 		 510 aa  69.7  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  28.47 
 
 		 530 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  24.22 
 
 		 481 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  25.36 
 
 		 1005 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  25.22 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  22.83 
 
 		 860 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.33 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  26.18 
 
 		 748 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  25.37 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1224  N-6 DNA methylase  23.29 
 
 		 796 aa  68.2  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.708606 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  23.32 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  23.21 
 
 		 846 aa  67.8  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  23.02 
 
 		 891 aa  67.8  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  24.51 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.45 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  25.64 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  25.52 
 
 		 529 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3648  N-6 DNA methylase  25.52 
 
 		 529 aa  67  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  25.52 
 
 		 529 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.41 
 
 		 703 aa  67.8  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  25.56 
 
 		 518 aa  67.4  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.61 
 
 		 680 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  25.5 
 
 		 529 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  26.86 
 
 		 488 aa  67.4  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  28.94 
 
 		 489 aa  67.4  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  21.76 
 
 		 518 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  26.57 
 
 		 489 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  28.02 
 
 		 477 aa  67  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.23 
 
 		 504 aa  67.4  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  23.23 
 
 		 799 aa  67  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  23.05 
 
 		 480 aa  66.6  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  26.48 
 
 		 710 aa  66.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  24.83 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  26.06 
 
 		 510 aa  66.6  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  24.58 
 
 		 574 aa  66.6  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  26.54 
 
 		 488 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  24.82 
 
 		 496 aa  66.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>