93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1062 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  100 
 
 		 1231 aa  2505    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1093 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1022 aa  184  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1518  hypothetical protein  38.78 
 
 		 189 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0308  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1086 aa  100  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  21.86 
 
 		 1132 aa  83.2  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1036 aa  76.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1338 aa  74.3  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.56 
 
 		 995 aa  71.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  21.04 
 
 		 1058 aa  67.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  32.77 
 
 		 1222 aa  63.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  20.03 
 
 		 1076 aa  63.5  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  33.82 
 
 		 1322 aa  63.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  21.61 
 
 		 1154 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1195 aa  62  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  23.84 
 
 		 557 aa  61.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1162 aa  59.7  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1299 aa  58.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  31.69 
 
 		 1209 aa  57.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  32.72 
 
 		 1322 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  31.25 
 
 		 416 aa  57.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  36.94 
 
 		 1189 aa  55.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  34.56 
 
 		 1459 aa  55.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  19.95 
 
 		 1257 aa  55.8  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  29.09 
 
 		 504 aa  55.5  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1282 aa  55.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  21.19 
 
 		 1241 aa  55.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  20.4 
 
 		 1159 aa  55.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  32.31 
 
 		 573 aa  55.1  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  30.15 
 
 		 694 aa  55.1  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  31.43 
 
 		 1319 aa  55.1  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  20.73 
 
 		 1244 aa  55.1  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  30.6 
 
 		 1002 aa  54.3  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2728  putative DNA methylase  34.66 
 
 		 1208 aa  54.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0392  N-6 DNA methylase  30.39 
 
 		 967 aa  53.5  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  30.57 
 
 		 1239 aa  54.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1125 aa  53.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1612 aa  53.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  28.95 
 
 		 928 aa  53.5  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  34.55 
 
 		 466 aa  52.8  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  29.55 
 
 		 518 aa  52.4  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  33.56 
 
 		 1339 aa  52.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  20.89 
 
 		 1177 aa  52  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1426 aa  50.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  33.62 
 
 		 1306 aa  50.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  21.88 
 
 		 524 aa  50.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  37.07 
 
 		 1055 aa  50.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  31.25 
 
 		 490 aa  50.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  27.72 
 
 		 1336 aa  50.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1373 aa  49.3  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1162 aa  49.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  27.51 
 
 		 673 aa  49.3  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  29.91 
 
 		 479 aa  49.3  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  24.37 
 
 		 933 aa  48.9  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  23.32 
 
 		 909 aa  48.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  20.43 
 
 		 1432 aa  48.5  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1233 aa  48.5  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  28.43 
 
 		 1038 aa  48.5  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  23.15 
 
 		 562 aa  48.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  28.46 
 
 		 489 aa  48.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  29.13 
 
 		 488 aa  48.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  28.35 
 
 		 488 aa  47.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1147 aa  47.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  27.96 
 
 		 1100 aa  47.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1178 aa  47.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1231 aa  47.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  27.81 
 
 		 578 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  24.63 
 
 		 500 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  27.69 
 
 		 489 aa  47.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  21.23 
 
 		 836 aa  47.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  27.1 
 
 		 484 aa  47.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  27.81 
 
 		 578 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  28.46 
 
 		 489 aa  47.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  27.69 
 
 		 489 aa  47.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  30.58 
 
 		 595 aa  47.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  33.93 
 
 		 1219 aa  47  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1104 aa  47  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  40 
 
 		 604 aa  46.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  38.68 
 
 		 1581 aa  46.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  26.13 
 
 		 1343 aa  47  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  28.68 
 
 		 477 aa  46.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  27.45 
 
 		 493 aa  46.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  28.12 
 
 		 489 aa  45.8  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  28.12 
 
 		 489 aa  45.8  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1338 aa  45.8  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  29.23 
 
 		 492 aa  45.4  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  34.96 
 
 		 1422 aa  45.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  29.37 
 
 		 950 aa  45.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1457  type I restriction-modification system, M subunit, putative  21.84 
 
 		 684 aa  45.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  31.86 
 
 		 1338 aa  45.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  26.35 
 
 		 489 aa  45.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  28.68 
 
 		 489 aa  45.1  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  25 
 
 		 510 aa  45.1  0.009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>