More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0004 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1303  N-6 DNA methylase  82.01 
 
 
529 aa  869    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1221  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  60.3 
 
 
533 aa  637    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  62.38 
 
 
528 aa  662    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  100 
 
 
517 aa  1057    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  60.61 
 
 
508 aa  631  1e-179  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0022  N-6 DNA methylase  60.6 
 
 
495 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0030  N-6 DNA methylase  60.6 
 
 
495 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0191758 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2329  N-6 DNA methylase  56.14 
 
 
538 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1712  N-6 DNA methylase  54.12 
 
 
662 aa  495  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.857909  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2365  N-6 DNA methylase  46.97 
 
 
526 aa  479  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.725173  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2469  N-6 DNA methylase  50.81 
 
 
772 aa  422  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3498  N-6 DNA methylase  49.89 
 
 
694 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0332  N-6 DNA methylase  46.3 
 
 
709 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4352  N-6 DNA methylase  45.51 
 
 
565 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  39.77 
 
 
519 aa  365  1e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  40.32 
 
 
517 aa  362  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.61 
 
 
538 aa  362  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.3 
 
 
497 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  40.65 
 
 
514 aa  355  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  38.87 
 
 
521 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  38.96 
 
 
501 aa  352  8e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  38.12 
 
 
525 aa  352  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  38.12 
 
 
525 aa  352  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  38.33 
 
 
498 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  38.77 
 
 
501 aa  350  3e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  39.27 
 
 
515 aa  349  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  40.45 
 
 
540 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  37.69 
 
 
510 aa  348  1e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  37.38 
 
 
520 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  39.46 
 
 
518 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  39.39 
 
 
532 aa  347  3e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  39.66 
 
 
519 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  38.1 
 
 
503 aa  347  4e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  38.02 
 
 
529 aa  343  4e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  38.31 
 
 
529 aa  342  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  37.43 
 
 
511 aa  341  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  38.02 
 
 
518 aa  341  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  38.36 
 
 
540 aa  341  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  38.65 
 
 
576 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  37.94 
 
 
540 aa  335  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  38.21 
 
 
500 aa  334  2e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  38.64 
 
 
527 aa  333  3e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  36.81 
 
 
539 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  38.18 
 
 
523 aa  332  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  37.43 
 
 
527 aa  331  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  37.87 
 
 
535 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  37.79 
 
 
517 aa  325  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  38.17 
 
 
543 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  36.1 
 
 
544 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  36.53 
 
 
540 aa  319  6e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  38.36 
 
 
548 aa  313  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3910  N-6 DNA methylase  49.11 
 
 
356 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  36.96 
 
 
544 aa  310  5e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  36.97 
 
 
541 aa  309  9e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  37.14 
 
 
528 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  34.75 
 
 
564 aa  305  9.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  37.04 
 
 
544 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  34.66 
 
 
567 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  34.71 
 
 
567 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  33.8 
 
 
569 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.14 
 
 
549 aa  286  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  32.65 
 
 
570 aa  282  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  31.83 
 
 
568 aa  273  6e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  32.12 
 
 
510 aa  270  4e-71  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  33.71 
 
 
537 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  32.88 
 
 
849 aa  223  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  30.88 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  33.27 
 
 
633 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  30.49 
 
 
587 aa  210  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  30.3 
 
 
574 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  30.63 
 
 
574 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  33.59 
 
 
585 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  30.6 
 
 
574 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  31.6 
 
 
523 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  31.6 
 
 
508 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  30.04 
 
 
505 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  29.23 
 
 
522 aa  196  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  29.84 
 
 
523 aa  194  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  31.89 
 
 
808 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  30.08 
 
 
499 aa  192  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  29.84 
 
 
499 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  29.69 
 
 
504 aa  191  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  28.66 
 
 
511 aa  187  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  30.22 
 
 
816 aa  186  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  28.2 
 
 
505 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  29.72 
 
 
860 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  28.66 
 
 
815 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  28.19 
 
 
527 aa  179  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  28.14 
 
 
814 aa  179  9e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  28.18 
 
 
523 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  30.31 
 
 
908 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  31.71 
 
 
822 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  29.14 
 
 
516 aa  176  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  27.99 
 
 
498 aa  174  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  30.48 
 
 
568 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  26.14 
 
 
495 aa  172  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  28.86 
 
 
496 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  28.12 
 
 
513 aa  170  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  28.31 
 
 
498 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  27.79 
 
 
500 aa  167  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>