117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2480 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 587 aa  1123    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  31.1 
 
 		 554 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  30.9 
 
 		 552 aa  120  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1184 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1210 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  34.02 
 
 		 527 aa  102  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  26.46 
 
 		 694 aa  95.5  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  25.78 
 
 		 504 aa  93.2  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  28.61 
 
 		 539 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  27.16 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  22.91 
 
 		 527 aa  78.6  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  29.73 
 
 		 629 aa  77.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  31.91 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  30.09 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0309  hypothetical protein  27.8 
 
 		 691 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  26.32 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  21.46 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  29.64 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  22.2 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1154 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  20.11 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  27.27 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  21.31 
 
 		 416 aa  67  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  19.57 
 
 		 1257 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  23.14 
 
 		 746 aa  66.6  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1036 aa  65.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1338 aa  65.1  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  26.38 
 
 		 534 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  20.09 
 
 		 1159 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  25.41 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  21.45 
 
 		 1244 aa  60.5  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  24.09 
 
 		 562 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  20.86 
 
 		 1132 aa  58.9  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  24.15 
 
 		 1285 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  24.6 
 
 		 995 aa  59.3  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  25 
 
 		 1426 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  28.17 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  30.33 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  24.94 
 
 		 557 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.54 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1120 aa  58.2  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.85 
 
 		 1076 aa  55.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  24.48 
 
 		 537 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  29.38 
 
 		 1956 aa  54.7  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  28.49 
 
 		 1606 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  19.9 
 
 		 974 aa  54.7  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.75 
 
 		 579 aa  54.7  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0747  hypothetical protein  28.97 
 
 		 217 aa  54.3  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000125614 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  24.07 
 
 		 799 aa  53.9  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  29.11 
 
 		 595 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1299 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  24.3 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  27.7 
 
 		 578 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  29.24 
 
 		 792 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  22.61 
 
 		 544 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  22.97 
 
 		 537 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  22.97 
 
 		 537 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  25.91 
 
 		 493 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  24.42 
 
 		 484 aa  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  27.7 
 
 		 578 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  24.9 
 
 		 584 aa  51.6  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  23.53 
 
 		 871 aa  51.2  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  23.26 
 
 		 484 aa  51.2  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  23.26 
 
 		 484 aa  51.2  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  24 
 
 		 1209 aa  50.8  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  21.2 
 
 		 486 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  23.97 
 
 		 527 aa  50.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  30.37 
 
 		 604 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  29.41 
 
 		 1575 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  28.46 
 
 		 768 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  24.9 
 
 		 534 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 1516 aa  49.7  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  35.96 
 
 		 505 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  24.64 
 
 		 517 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  23.53 
 
 		 535 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  24.47 
 
 		 540 aa  48.9  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  24.89 
 
 		 799 aa  48.5  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  25.86 
 
 		 510 aa  48.9  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.93 
 
 		 680 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  23.65 
 
 		 707 aa  48.5  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  28.49 
 
 		 1700 aa  47.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1748 aa  48.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  23.14 
 
 		 787 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  31.65 
 
 		 451 aa  47.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  34.88 
 
 		 1125 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  29.57 
 
 		 515 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  38.32 
 
 		 285 aa  47  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  28.86 
 
 		 563 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  30.36 
 
 		 494 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  23.35 
 
 		 847 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  25.71 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  24.39 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  30.36 
 
 		 495 aa  46.2  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  22.5 
 
 		 410 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1177 aa  46.2  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  26 
 
 		 673 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  24.88 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  18.66 
 
 		 1186 aa  45.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  25.78 
 
 		 670 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  27.97 
 
 		 489 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>