80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0478 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  40.37 
 
 		 871 aa  657    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  43.35 
 
 		 937 aa  813    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  40.78 
 
 		 914 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  51.08 
 
 		 933 aa  969    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  100 
 
 		 908 aa  1870    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  45.77 
 
 		 928 aa  842    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  39.89 
 
 		 934 aa  678    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  51.39 
 
 		 909 aa  934    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  39.43 
 
 		 916 aa  598  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  39.52 
 
 		 912 aa  587  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  37.76 
 
 		 919 aa  585  1.0000000000000001e-165  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  34.62 
 
 		 941 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  37.43 
 
 		 934 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  36.35 
 
 		 955 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  36.55 
 
 		 929 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  33.76 
 
 		 926 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  33.61 
 
 		 928 aa  489  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  33.1 
 
 		 926 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  32.03 
 
 		 921 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  33.94 
 
 		 932 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  32.61 
 
 		 909 aa  455  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  32.11 
 
 		 928 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  32.37 
 
 		 929 aa  445  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  32.25 
 
 		 918 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  31.96 
 
 		 622 aa  278  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  24.87 
 
 		 925 aa  191  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  24.29 
 
 		 918 aa  184  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1151 aa  184  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1184 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  26.1 
 
 		 978 aa  173  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  23.93 
 
 		 1186 aa  170  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  27.36 
 
 		 621 aa  160  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1018 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1173 aa  153  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1170 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  25.73 
 
 		 973 aa  145  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1154 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1188 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  22.72 
 
 		 869 aa  96.3  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1353 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  51.14 
 
 		 97 aa  82.8  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  21.55 
 
 		 1290 aa  75.1  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1282 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1321 aa  71.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1366 aa  68.2  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1346 aa  67  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1342 aa  61.6  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1298 aa  59.3  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  26.4 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  22.53 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  20.3 
 
 		 1347 aa  56.6  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  21.18 
 
 		 536 aa  52.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.44 
 
 		 974 aa  52.4  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1104 aa  52  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  27.14 
 
 		 477 aa  51.6  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1452 aa  50.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  25 
 
 		 1195 aa  49.3  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1622  hypothetical protein  49.02 
 
 		 53 aa  49.7  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1461 aa  48.5  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  27.1 
 
 		 1041 aa  48.1  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  27.27 
 
 		 519 aa  48.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  23.32 
 
 		 673 aa  48.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  23.42 
 
 		 416 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  33.82 
 
 		 1205 aa  47.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  22.51 
 
 		 493 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.15 
 
 		 995 aa  46.6  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  26.03 
 
 		 500 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  29.05 
 
 		 703 aa  47  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.44 
 
 		 1002 aa  46.6  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  27.27 
 
 		 1160 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  27.1 
 
 		 489 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  25.79 
 
 		 493 aa  46.2  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  25.34 
 
 		 501 aa  46.2  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  32.81 
 
 		 1180 aa  46.2  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  37.33 
 
 		 1324 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  21.32 
 
 		 1363 aa  45.8  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  34.38 
 
 		 1167 aa  45.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  24.14 
 
 		 502 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1457  type I restriction-modification system, M subunit, putative  22.18 
 
 		 684 aa  45.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  27.34 
 
 		 486 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>