142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2544 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  43.11 
 
 		 1347 aa  967    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  61.73 
 
 		 1440 aa  1633    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  41.72 
 
 		 1339 aa  920    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  35.43 
 
 		 1441 aa  671    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  42.49 
 
 		 1365 aa  962    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  41.72 
 
 		 1339 aa  920    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  39.22 
 
 		 1452 aa  791    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  40.38 
 
 		 1461 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  100 
 
 		 1346 aa  2730    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  58.53 
 
 		 1363 aa  1534    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  53.76 
 
 		 1347 aa  1327    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  42.36 
 
 		 1409 aa  983    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  40.55 
 
 		 1366 aa  863    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1342 aa  569  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1321 aa  554  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1353 aa  552  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  51.66 
 
 		 536 aa  496  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  39.07 
 
 		 846 aa  444  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  35.53 
 
 		 1243 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  39.67 
 
 		 1282 aa  347  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  39.39 
 
 		 1290 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1581 aa  178  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  29.37 
 
 		 512 aa  169  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  30.27 
 
 		 1432 aa  162  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  30.06 
 
 		 925 aa  155  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  26.87 
 
 		 978 aa  154  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1173 aa  152  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1151 aa  151  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1170 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1188 aa  147  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1018 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  28.64 
 
 		 918 aa  141  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  32.51 
 
 		 1343 aa  137  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  29.74 
 
 		 1154 aa  136  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1709 aa  127  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  25.51 
 
 		 869 aa  125  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1339 aa  124  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1184 aa  123  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1422 aa  122  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1375 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1022 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  26.44 
 
 		 1186 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  28.45 
 
 		 1336 aa  119  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  29.03 
 
 		 1306 aa  115  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1612 aa  115  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  29.41 
 
 		 1322 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1332 aa  114  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  27.59 
 
 		 1358 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  24.58 
 
 		 1712 aa  112  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  27.74 
 
 		 1219 aa  110  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  30.33 
 
 		 1331 aa  109  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1098 aa  107  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  27.76 
 
 		 430 aa  106  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  40 
 
 		 1338 aa  105  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  27.86 
 
 		 1355 aa  104  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1459 aa  103  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  27.78 
 
 		 1354 aa  102  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  37.43 
 
 		 1319 aa  98.6  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  35.33 
 
 		 1338 aa  98.6  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1349 aa  97.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1557 aa  94.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  27.24 
 
 		 973 aa  94.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  26.37 
 
 		 1318 aa  93.2  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  35.98 
 
 		 1055 aa  93.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  28.17 
 
 		 1321 aa  91.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1426 aa  90.1  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  24.3 
 
 		 1277 aa  89.4  4e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  22.38 
 
 		 1278 aa  88.2  9e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  30.89 
 
 		 1373 aa  87.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  33.54 
 
 		 1333 aa  86.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  26.71 
 
 		 1442 aa  85.5  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1546 aa  85.5  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  23.09 
 
 		 871 aa  84.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  21.08 
 
 		 1159 aa  82  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  29.92 
 
 		 1322 aa  81.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1184 aa  81.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1751 aa  77.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.61 
 
 		 926 aa  75.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1640 aa  75.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  30.25 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  31.5 
 
 		 974 aa  75.1  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1642 aa  74.3  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  27.21 
 
 		 1020 aa  73.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  28.81 
 
 		 1058 aa  73.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1572 aa  73.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1579 aa  73.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1644 aa  73.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  19.25 
 
 		 1076 aa  70.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  22 
 
 		 918 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  21.98 
 
 		 1186 aa  70.1  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  23.98 
 
 		 928 aa  69.3  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1575 aa  69.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  22 
 
 		 1250 aa  68.6  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.03 
 
 		 995 aa  68.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1210 aa  67.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  22.42 
 
 		 908 aa  67.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  21.71 
 
 		 1250 aa  66.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1104 aa  65.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1299 aa  64.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  32.94 
 
 		 926 aa  64.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>