41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1426 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  100 
 
 		 430 aa  888    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  41.5 
 
 		 1173 aa  313  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  43.17 
 
 		 1154 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  38.62 
 
 		 1184 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  40.86 
 
 		 1170 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  43.85 
 
 		 1018 aa  259  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  36.24 
 
 		 869 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  35.57 
 
 		 1151 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  36.99 
 
 		 1188 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  43.94 
 
 		 1186 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  34.94 
 
 		 918 aa  173  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  30.36 
 
 		 925 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  27.67 
 
 		 973 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  29.97 
 
 		 1353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1346 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  30.3 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1282 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1409 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1365 aa  96.7  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1440 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1347 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1366 aa  93.2  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  29.24 
 
 		 536 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1363 aa  86.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1290 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1342 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1243 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1347 aa  73.9  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  25 
 
 		 978 aa  73.2  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1339 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1441 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1339 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1321 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1452 aa  67.4  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  22.04 
 
 		 912 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2741  hypothetical protein  43.93 
 
 		 118 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1461 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  32.67 
 
 		 928 aa  53.9  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  26.29 
 
 		 512 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  25.89 
 
 		 937 aa  47  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  24.68 
 
 		 926 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>