148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0223 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  100 
 
 
1342 aa  2760    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  64.84 
 
 
1321 aa  1743    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  35.16 
 
 
1452 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  34.36 
 
 
1461 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  40.03 
 
 
1353 aa  857    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  36.38 
 
 
1409 aa  725    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  32.02 
 
 
1346 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  32.31 
 
 
1441 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  31.9 
 
 
1363 aa  558  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  30.35 
 
 
1440 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  30.95 
 
 
1339 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  30.95 
 
 
1339 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  30.81 
 
 
1365 aa  476  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  30.67 
 
 
1347 aa  459  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  35.55 
 
 
1243 aa  416  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  35.52 
 
 
1347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  32.96 
 
 
1282 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  33.3 
 
 
1290 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  36.08 
 
 
846 aa  317  9e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  37.94 
 
 
536 aa  305  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  34.4 
 
 
1366 aa  269  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  30.16 
 
 
512 aa  214  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  26.14 
 
 
1581 aa  203  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  28.7 
 
 
978 aa  164  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  25.83 
 
 
1151 aa  152  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  28.64 
 
 
1709 aa  152  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  23.14 
 
 
1250 aa  148  9e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  22.52 
 
 
1250 aa  148  9e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  29.05 
 
 
1432 aa  147  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  26.04 
 
 
1022 aa  142  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  26.04 
 
 
1375 aa  141  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  29.52 
 
 
925 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.13 
 
 
1612 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  31.69 
 
 
918 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  24.29 
 
 
1712 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  27.7 
 
 
1173 aa  132  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  30.41 
 
 
1343 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  25.23 
 
 
1098 aa  126  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  28.57 
 
 
1170 aa  126  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  31.22 
 
 
1354 aa  126  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  29.76 
 
 
1572 aa  125  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  26.49 
 
 
1751 aa  125  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  32.65 
 
 
1338 aa  124  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  26.59 
 
 
1426 aa  121  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  27.29 
 
 
1184 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  29.79 
 
 
1575 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  27.25 
 
 
1358 aa  118  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  29.02 
 
 
1306 aa  116  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  25.55 
 
 
1319 aa  115  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  27.65 
 
 
1322 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  30.59 
 
 
1422 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  26.85 
 
 
1557 aa  114  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  27.99 
 
 
1331 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  25.7 
 
 
1188 aa  112  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  27.98 
 
 
1018 aa  112  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  25.82 
 
 
1338 aa  111  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  28.9 
 
 
1339 aa  110  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  28.89 
 
 
1459 aa  108  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  27.46 
 
 
1278 aa  108  9e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  26.65 
 
 
1186 aa  107  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  26.19 
 
 
1154 aa  107  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  27.4 
 
 
1442 aa  107  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  36.84 
 
 
1373 aa  106  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  26.08 
 
 
1349 aa  105  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  25.08 
 
 
1277 aa  105  8e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  24.27 
 
 
869 aa  103  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  28.57 
 
 
1321 aa  102  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  27.87 
 
 
1581 aa  101  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  26.37 
 
 
1640 aa  100  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.09 
 
 
1640 aa  99.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  26.54 
 
 
1579 aa  99.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  26.18 
 
 
1644 aa  99.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  26.18 
 
 
1642 aa  99.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  25.78 
 
 
1332 aa  98.6  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  28 
 
 
1219 aa  96.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  32.2 
 
 
1333 aa  95.1  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  27.03 
 
 
1546 aa  94.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  27.14 
 
 
1355 aa  94.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.38 
 
 
1573 aa  90.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  36.59 
 
 
1318 aa  89.4  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.61 
 
 
1194 aa  88.6  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  26.99 
 
 
1336 aa  88.6  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  24.53 
 
 
1299 aa  86.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  23.06 
 
 
1252 aa  85.1  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  23.33 
 
 
1186 aa  82.8  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  35.76 
 
 
1322 aa  80.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  22.71 
 
 
912 aa  79.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  27.14 
 
 
1055 aa  79.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  26.89 
 
 
973 aa  79.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  21.79 
 
 
1244 aa  79  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  21.66 
 
 
1257 aa  78.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  26.29 
 
 
1184 aa  77  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  25.93 
 
 
941 aa  76.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  27.15 
 
 
430 aa  74.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  31.35 
 
 
926 aa  72.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  26.92 
 
 
1210 aa  68.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  20.31 
 
 
1170 aa  67.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  24.5 
 
 
934 aa  67.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  21.19 
 
 
1159 aa  67.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  22.93 
 
 
908 aa  66.2  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>