100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3627 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  37.76 
 
 		 1349 aa  670    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  100 
 
 		 1098 aa  2237    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  54.47 
 
 		 1022 aa  1051    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  54.37 
 
 		 1375 aa  1047    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  33.77 
 
 		 1332 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1612 aa  253  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  28.95 
 
 		 1432 aa  226  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1250 aa  216  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1250 aa  214  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1426 aa  196  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  26.32 
 
 		 1319 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1339 aa  184  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1459 aa  183  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  26.4 
 
 		 1336 aa  178  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  25.55 
 
 		 1712 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  26.04 
 
 		 1343 aa  176  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1338 aa  161  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  24.15 
 
 		 1354 aa  160  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  24.18 
 
 		 1277 aa  156  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  25.43 
 
 		 1322 aa  154  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  23.51 
 
 		 1278 aa  154  8.999999999999999e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  24.84 
 
 		 1318 aa  153  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  24.36 
 
 		 1442 aa  153  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1422 aa  150  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1333 aa  142  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  25.51 
 
 		 1219 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1581 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  25.46 
 
 		 1355 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  24.62 
 
 		 1358 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  24.23 
 
 		 1306 aa  134  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  24.84 
 
 		 1322 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  25.08 
 
 		 1321 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  23.95 
 
 		 1055 aa  132  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  26.96 
 
 		 1331 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  28.21 
 
 		 1338 aa  127  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1461 aa  126  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1290 aa  127  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1282 aa  127  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1373 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1342 aa  126  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1441 aa  125  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1298 aa  119  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1452 aa  116  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1709 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1363 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1347 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1243 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  25 
 
 		 1409 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1346 aa  107  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1321 aa  106  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1353 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  26.86 
 
 		 846 aa  97.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1440 aa  96.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1347 aa  95.9  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1572 aa  94.7  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  27.29 
 
 		 1546 aa  93.6  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  25 
 
 		 1339 aa  91.3  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  25 
 
 		 1339 aa  91.3  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1575 aa  86.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1365 aa  84.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.78 
 
 		 1640 aa  81.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.04 
 
 		 1573 aa  80.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  24.31 
 
 		 1581 aa  79.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1644 aa  78.2  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1642 aa  77.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1640 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1557 aa  75.5  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1366 aa  71.6  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  25.87 
 
 		 926 aa  71.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1579 aa  69.3  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1751 aa  65.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  20.34 
 
 		 1186 aa  65.1  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  20 
 
 		 1194 aa  63.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1209 aa  62  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1088 aa  60.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25.47 
 
 		 950 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.93 
 
 		 1020 aa  59.3  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  21.57 
 
 		 1299 aa  59.3  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  21.02 
 
 		 1252 aa  57.4  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  20.86 
 
 		 1177 aa  57  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  28.93 
 
 		 1041 aa  56.2  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  22.11 
 
 		 974 aa  56.6  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1147 aa  55.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  21.68 
 
 		 1256 aa  53.9  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  24.73 
 
 		 882 aa  53.5  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  19.92 
 
 		 1104 aa  53.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  21.23 
 
 		 1244 aa  53.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1154 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  21.48 
 
 		 1257 aa  52  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  25.09 
 
 		 838 aa  51.6  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1210 aa  51.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1338 aa  50.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  20.82 
 
 		 1089 aa  49.3  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  20.9 
 
 		 1178 aa  47.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1195 aa  47  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  28.34 
 
 		 1222 aa  46.6  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  23.24 
 
 		 1132 aa  46.2  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  27.14 
 
 		 826 aa  46.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  28.68 
 
 		 1170 aa  45.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.27 
 
 		 836 aa  45.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>