160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04295 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  100 
 
 		 1020 aa  2071    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  34.79 
 
 		 1058 aa  533  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  29.98 
 
 		 1036 aa  434  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  32.22 
 
 		 995 aa  432  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  26.3 
 
 		 950 aa  317  7e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.37 
 
 		 836 aa  258  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  31.28 
 
 		 1256 aa  207  8e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  29.96 
 
 		 1252 aa  206  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.01 
 
 		 974 aa  171  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  22.02 
 
 		 652 aa  157  7e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  24.89 
 
 		 795 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1177 aa  137  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1426 aa  118  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.69 
 
 		 1076 aa  117  8.999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  21.63 
 
 		 1154 aa  114  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  23.85 
 
 		 684 aa  104  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2211  hypothetical protein  39.57 
 
 		 162 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00033176  normal  0.0601235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  27.36 
 
 		 416 aa  98.6  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  23.4 
 
 		 1257 aa  96.7  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  26.02 
 
 		 410 aa  92  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1209 aa  92  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1120 aa  91.7  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  23.08 
 
 		 1170 aa  90.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  31.11 
 
 		 1041 aa  89.7  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  22.31 
 
 		 1299 aa  88.6  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1178 aa  84  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1147 aa  83.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  22.97 
 
 		 1244 aa  84  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1016 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1125 aa  75.9  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  22.51 
 
 		 570 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1612 aa  75.1  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  21.91 
 
 		 1159 aa  75.1  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1282 aa  74.7  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  21.43 
 
 		 1432 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1346 aa  73.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  29.08 
 
 		 1278 aa  74.3  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  29.08 
 
 		 1277 aa  74.3  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1039 aa  73.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  24.48 
 
 		 792 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  28.64 
 
 		 816 aa  72.4  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  20.93 
 
 		 1104 aa  72  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1347 aa  71.6  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1581 aa  71.2  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1366 aa  70.1  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  23.47 
 
 		 1002 aa  69.3  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  22.18 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1365 aa  68.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  22.35 
 
 		 1055 aa  68.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  22.64 
 
 		 908 aa  68.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  25.94 
 
 		 1338 aa  67.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  26.46 
 
 		 1358 aa  67.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1338 aa  67.4  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  25.71 
 
 		 826 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0121  putative DNA methylase  22.2 
 
 		 1022 aa  66.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  25.88 
 
 		 1319 aa  66.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  23.57 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  21.24 
 
 		 1195 aa  65.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.61 
 
 		 1194 aa  65.1  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  17.54 
 
 		 629 aa  65.1  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1339 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1339 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  21.17 
 
 		 746 aa  63.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1347 aa  63.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  19.81 
 
 		 1132 aa  62.8  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1440 aa  62  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  21.05 
 
 		 1338 aa  62  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  23.36 
 
 		 1219 aa  61.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1332 aa  60.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1088 aa  61.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1452 aa  60.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  24.12 
 
 		 1322 aa  60.1  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1363 aa  60.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  29.93 
 
 		 838 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1349 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1422 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  21.33 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1098 aa  59.3  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  25 
 
 		 1339 aa  58.9  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1375 aa  58.9  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1022 aa  58.9  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1461 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  23.32 
 
 		 1038 aa  58.2  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1243 aa  57.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2384  hypothetical protein  25.31 
 
 		 732 aa  57.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1353 aa  57.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1333 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  26.04 
 
 		 1321 aa  56.6  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1441 aa  56.6  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  21.71 
 
 		 1459 aa  57  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  23.93 
 
 		 1355 aa  57  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  18.23 
 
 		 1222 aa  56.2  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1800  hypothetical protein  27.03 
 
 		 372 aa  56.2  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  23.11 
 
 		 1336 aa  55.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1557 aa  55.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1290 aa  55.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1210 aa  55.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  19.86 
 
 		 1183 aa  54.7  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  25.68 
 
 		 846 aa  54.7  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  20 
 
 		 1144 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>