59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0584 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  100 
 
 
826 aa  1682    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  24.59 
 
 
1343 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  26.21 
 
 
1322 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  24.03 
 
 
1355 aa  145  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  23.97 
 
 
1459 aa  145  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  22.3 
 
 
1306 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  21.83 
 
 
1055 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  24.78 
 
 
1422 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  26.42 
 
 
1373 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  22.28 
 
 
1338 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  22.39 
 
 
1318 aa  133  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  22.12 
 
 
1339 aa  132  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  22.02 
 
 
1336 aa  132  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  24.72 
 
 
1333 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  23.3 
 
 
1338 aa  125  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  22.16 
 
 
1354 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  21.96 
 
 
1219 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  22.05 
 
 
1331 aa  120  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  21.55 
 
 
1322 aa  120  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  20.31 
 
 
1321 aa  115  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  22.05 
 
 
1442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  20.15 
 
 
1358 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  23.59 
 
 
1250 aa  111  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  21.22 
 
 
1319 aa  111  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  23.15 
 
 
1250 aa  105  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  24.26 
 
 
1581 aa  96.3  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  30.57 
 
 
1712 aa  95.9  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  21.32 
 
 
1278 aa  85.5  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  22.14 
 
 
1277 aa  83.2  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  22.15 
 
 
1709 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  20.54 
 
 
1375 aa  67.8  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  25.71 
 
 
1020 aa  67.8  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  25.7 
 
 
1058 aa  58.5  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  21.8 
 
 
1332 aa  58.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  29.35 
 
 
836 aa  54.7  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  21.45 
 
 
1022 aa  53.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.86 
 
 
995 aa  52.4  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2233  hypothetical protein  18.94 
 
 
544 aa  50.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  27.67 
 
 
1282 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  21.72 
 
 
652 aa  49.3  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  23.87 
 
 
1347 aa  49.3  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  27.04 
 
 
1290 aa  49.3  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  22.84 
 
 
926 aa  48.9  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  19.85 
 
 
795 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  22.75 
 
 
1243 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  21.54 
 
 
1298 aa  47.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  24.05 
 
 
1366 aa  47.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0308  hypothetical protein  26.45 
 
 
1086 aa  46.6  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  27.14 
 
 
1098 aa  46.2  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  19.87 
 
 
673 aa  45.8  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  25.15 
 
 
1173 aa  45.4  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  29.05 
 
 
1041 aa  45.4  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  23 
 
 
578 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  22.22 
 
 
974 aa  45.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  27.35 
 
 
1093 aa  45.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  23 
 
 
578 aa  45.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  21.68 
 
 
1125 aa  44.7  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  23.33 
 
 
1022 aa  44.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  26.44 
 
 
1546 aa  44.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.910685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>