104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3668 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  100 
 
 		 1088 aa  2237    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  46.29 
 
 		 838 aa  731    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  34.95 
 
 		 882 aa  526  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  33.53 
 
 		 792 aa  190  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  28.1 
 
 		 1089 aa  174  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  30.71 
 
 		 816 aa  174  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  25.73 
 
 		 1170 aa  121  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1104 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1209 aa  117  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1147 aa  114  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1120 aa  110  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1177 aa  111  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1154 aa  102  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1210 aa  101  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  28.98 
 
 		 1252 aa  98.2  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1298 aa  97.4  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  28.04 
 
 		 1132 aa  95.9  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  29.82 
 
 		 1257 aa  95.9  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1338 aa  95.9  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1039 aa  93.6  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  29.56 
 
 		 1244 aa  92  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1476  hypothetical protein  28.03 
 
 		 247 aa  91.3  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000317669  normal  0.706918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1184 aa  89.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26 
 
 		 1194 aa  88.2  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1178 aa  87.4  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  30.37 
 
 		 1159 aa  84.7  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  26.88 
 
 		 1256 aa  82  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  25.73 
 
 		 1041 aa  77.8  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  25.77 
 
 		 1076 aa  75.9  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  32.24 
 
 		 995 aa  73.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1339 aa  72  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1441 aa  70.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1299 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  31.13 
 
 		 1058 aa  68.9  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  25 
 
 		 1365 aa  68.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1290 aa  66.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1363 aa  65.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1321 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1282 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1459 aa  62.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  31.36 
 
 		 1186 aa  63.2  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1347 aa  62.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  25 
 
 		 1712 aa  62.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1612 aa  62.4  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1036 aa  61.6  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1426 aa  61.6  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  33.58 
 
 		 950 aa  61.2  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1098 aa  60.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  29.21 
 
 		 1020 aa  61.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  23.34 
 
 		 1432 aa  60.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1461 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1581 aa  58.2  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  22.83 
 
 		 1306 aa  58.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  23.78 
 
 		 1277 aa  57.8  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  23.3 
 
 		 1343 aa  57.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  21.55 
 
 		 1022 aa  56.6  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  21.84 
 
 		 1336 aa  56.6  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  20.77 
 
 		 1422 aa  56.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1375 aa  56.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1425 aa  56.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1353 aa  55.8  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  23.55 
 
 		 955 aa  55.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  20.26 
 
 		 1339 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  20.26 
 
 		 1339 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.19 
 
 		 1452 aa  54.3  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  24.83 
 
 		 1278 aa  54.3  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  24.64 
 
 		 1055 aa  53.5  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  30.92 
 
 		 974 aa  53.9  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  34.91 
 
 		 836 aa  53.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1332 aa  52.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1324 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1338 aa  51.6  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1333 aa  51.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1359 aa  51.2  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1572 aa  50.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  27.81 
 
 		 795 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  27.63 
 
 		 1338 aa  50.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  26.97 
 
 		 1358 aa  50.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  28.57 
 
 		 1318 aa  49.3  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1243 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1575 aa  48.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1440 aa  48.1  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1373 aa  48.1  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1250 aa  47.8  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  31.25 
 
 		 416 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2384  hypothetical protein  18.54 
 
 		 732 aa  48.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  20.73 
 
 		 1497 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1346 aa  48.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1250 aa  47  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1642 aa  46.6  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.82 
 
 		 1640 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1644 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  25.41 
 
 		 919 aa  47.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1366 aa  47.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  24.53 
 
 		 1581 aa  46.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1640 aa  46.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  23.84 
 
 		 916 aa  45.8  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1579 aa  45.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  25.83 
 
 		 871 aa  45.4  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.6 
 
 		 1573 aa  45.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>