156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0410 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  100 
 
 		 1147 aa  2368    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  48.51 
 
 		 1120 aa  1065    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  48.75 
 
 		 1178 aa  771    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  43.5 
 
 		 1177 aa  946    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  35.93 
 
 		 1170 aa  632  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  31.57 
 
 		 1299 aa  445  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1154 aa  424  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  37.98 
 
 		 995 aa  390  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1338 aa  369  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1209 aa  333  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1426 aa  328  5e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  25.86 
 
 		 1076 aa  316  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  30.9 
 
 		 1036 aa  295  5e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  32.31 
 
 		 1159 aa  267  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  30.74 
 
 		 1089 aa  243  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  32.27 
 
 		 974 aa  238  7e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  28.76 
 
 		 1132 aa  236  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  33.68 
 
 		 1257 aa  235  3e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  34.12 
 
 		 1244 aa  231  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1210 aa  174  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1104 aa  154  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1039 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1184 aa  139  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  23.31 
 
 		 882 aa  135  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  27.47 
 
 		 410 aa  135  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1612 aa  131  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  25.49 
 
 		 1432 aa  127  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.16 
 
 		 1058 aa  126  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1298 aa  122  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  26.06 
 
 		 562 aa  119  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  27.27 
 
 		 557 aa  118  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.06 
 
 		 1194 aa  108  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1088 aa  109  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  24.54 
 
 		 1256 aa  105  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  24.54 
 
 		 1252 aa  104  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.54 
 
 		 950 aa  103  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  26.19 
 
 		 652 aa  98.2  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  28.3 
 
 		 416 aa  94.7  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  21.87 
 
 		 836 aa  94  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  22.88 
 
 		 629 aa  94.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  22.68 
 
 		 1041 aa  94  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  23.43 
 
 		 518 aa  93.2  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  29.11 
 
 		 247 aa  90.9  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  21.83 
 
 		 1020 aa  90.1  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  24.94 
 
 		 792 aa  77.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  32.04 
 
 		 1343 aa  75.9  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  23.21 
 
 		 404 aa  74.3  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  34.92 
 
 		 1186 aa  72.8  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  25 
 
 		 838 aa  72.4  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  21.29 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  20.22 
 
 		 493 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  29.79 
 
 		 816 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  23.46 
 
 		 570 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1346 aa  69.7  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  37.39 
 
 		 1338 aa  67  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  35.14 
 
 		 1336 aa  66.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  21.41 
 
 		 673 aa  65.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  33.56 
 
 		 1243 aa  64.7  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  31.4 
 
 		 1306 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  37.61 
 
 		 1333 aa  64.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  38.68 
 
 		 1321 aa  63.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1209 aa  63.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  24.83 
 
 		 694 aa  63.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  22.05 
 
 		 1189 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  25.61 
 
 		 1319 aa  62.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1347 aa  62.4  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1422 aa  62.4  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  33.07 
 
 		 1354 aa  62  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1452 aa  61.6  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  36.79 
 
 		 1358 aa  61.6  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  21.61 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  36.7 
 
 		 1055 aa  61.6  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2063  hypothetical protein  25.11 
 
 		 332 aa  61.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0829013  decreased coverage  0.00107186 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1461 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  26.38 
 
 		 534 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  32.23 
 
 		 1339 aa  60.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  25.78 
 
 		 1180 aa  59.7  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1338 aa  59.7  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  32.79 
 
 		 1373 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  23.39 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1321 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  29.69 
 
 		 846 aa  59.3  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  35.19 
 
 		 1318 aa  58.5  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1440 aa  58.2  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  35.45 
 
 		 1322 aa  58.2  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1162 aa  58.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  20.6 
 
 		 1430 aa  57.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  25.44 
 
 		 595 aa  58.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3037  hypothetical protein  25 
 
 		 330 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  34.23 
 
 		 1712 aa  57.4  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1441 aa  57  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  32.69 
 
 		 1331 aa  56.6  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  33.94 
 
 		 1355 aa  56.6  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  38.53 
 
 		 1347 aa  56.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1231 aa  56.2  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  21.25 
 
 		 1290 aa  55.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  27.81 
 
 		 466 aa  55.5  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1098 aa  55.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  28.57 
 
 		 1322 aa  55.1  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1241 aa  54.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>