10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3037 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3037  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  662    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2063  hypothetical protein  60.43 
 
 		 332 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0829013  decreased coverage  0.00107186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0591  hypothetical protein  31.62 
 
 		 292 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.49296 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1338 aa  59.3  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1154 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  25 
 
 		 1147 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1426 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  25 
 
 		 1036 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  23.97 
 
 		 995 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  25 
 
 		 1299 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>