123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1723 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  35.35 
 
 		 1257 aa  665    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  37.05 
 
 		 1244 aa  666    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  100 
 
 		 1299 aa  2665    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.28 
 
 		 1194 aa  621  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  31.2 
 
 		 1256 aa  534  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  33.13 
 
 		 1252 aa  528  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  33.6 
 
 		 1186 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  31.57 
 
 		 1147 aa  433  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1154 aa  382  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  41.92 
 
 		 1036 aa  353  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1177 aa  318  5e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1338 aa  281  7e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  35.4 
 
 		 995 aa  277  9e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  25.67 
 
 		 1159 aa  272  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1209 aa  270  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1426 aa  240  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  26.07 
 
 		 1132 aa  234  7.000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  33.05 
 
 		 1076 aa  217  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  31.36 
 
 		 974 aa  212  4e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  30.02 
 
 		 1120 aa  176  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  22.91 
 
 		 1432 aa  149  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  27.45 
 
 		 562 aa  114  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  23.95 
 
 		 410 aa  113  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  25.54 
 
 		 557 aa  111  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1210 aa  110  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  24.01 
 
 		 1089 aa  110  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1178 aa  110  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1298 aa  110  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  22.15 
 
 		 1170 aa  109  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  23.6 
 
 		 629 aa  103  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  33.48 
 
 		 247 aa  95.9  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1104 aa  94  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  23.88 
 
 		 518 aa  92.4  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1184 aa  92.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.31 
 
 		 1020 aa  88.6  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1342 aa  85.9  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1612 aa  86.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  25 
 
 		 570 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1461 aa  79.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  23.16 
 
 		 652 aa  76.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1452 aa  74.3  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1347 aa  73.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1333 aa  74.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1088 aa  72.8  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1321 aa  72.4  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  24.47 
 
 		 1354 aa  71.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  27.6 
 
 		 416 aa  70.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  30.23 
 
 		 1058 aa  70.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  30.07 
 
 		 836 aa  69.7  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1581 aa  69.7  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1250 aa  68.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  25.94 
 
 		 1041 aa  68.9  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1250 aa  67.8  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1440 aa  67.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1441 aa  67.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  32.76 
 
 		 423 aa  67  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  29.86 
 
 		 950 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  23.5 
 
 		 1712 aa  66.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  28.16 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  35.35 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  24.44 
 
 		 838 aa  64.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1346 aa  64.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1039 aa  63.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  31.94 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  21.93 
 
 		 1358 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1339 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1339 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  23.83 
 
 		 466 aa  61.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  23.19 
 
 		 527 aa  61.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1363 aa  60.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  26.19 
 
 		 694 aa  60.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  21.57 
 
 		 1098 aa  60.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  23.81 
 
 		 1336 aa  59.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  23.69 
 
 		 882 aa  59.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  23.51 
 
 		 1331 aa  58.9  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1373 aa  58.9  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  19.76 
 
 		 1306 aa  58.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1022 aa  58.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  22.88 
 
 		 1319 aa  58.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1231 aa  58.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  24.15 
 
 		 523 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  20.66 
 
 		 1339 aa  58.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  23 
 
 		 1409 aa  58.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1375 aa  57.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  23.83 
 
 		 1277 aa  57  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  35.23 
 
 		 604 aa  56.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1290 aa  56.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  27.93 
 
 		 1355 aa  56.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  29.57 
 
 		 1343 aa  56.2  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1332 aa  55.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  21.76 
 
 		 1278 aa  55.5  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2063  hypothetical protein  25.31 
 
 		 332 aa  55.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0829013  decreased coverage  0.00107186 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  26.85 
 
 		 389 aa  54.3  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  27.03 
 
 		 1322 aa  55.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  30 
 
 		 1338 aa  54.3  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  25.75 
 
 		 846 aa  53.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  32.91 
 
 		 595 aa  52.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  22 
 
 		 1282 aa  52  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1422 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  35.64 
 
 		 1243 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>