138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1424 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  100 
 
 
1194 aa  2438    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  33.36 
 
 
1299 aa  593  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  32.76 
 
 
1257 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  31.33 
 
 
1244 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  31.14 
 
 
1252 aa  459  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  35.44 
 
 
1256 aa  455  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  32.22 
 
 
1186 aa  434  1e-120  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  24.64 
 
 
1177 aa  141  6e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  23.93 
 
 
1298 aa  138  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  23.97 
 
 
1170 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  26.24 
 
 
1209 aa  129  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  22.64 
 
 
1154 aa  127  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  21.14 
 
 
1159 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  23.83 
 
 
1089 aa  122  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  23.18 
 
 
1104 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  22.79 
 
 
1132 aa  117  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  23.16 
 
 
1076 aa  117  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  24.62 
 
 
1178 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  27.14 
 
 
404 aa  112  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  22.89 
 
 
882 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  23.89 
 
 
1338 aa  108  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  22.33 
 
 
1432 aa  105  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  21.96 
 
 
1120 aa  105  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  27.27 
 
 
410 aa  102  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  24.06 
 
 
1147 aa  100  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  22.49 
 
 
1039 aa  95.9  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.48 
 
 
995 aa  90.9  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  22.85 
 
 
1426 aa  90.1  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  24.94 
 
 
838 aa  89.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  26 
 
 
1088 aa  88.6  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  22.43 
 
 
1036 aa  87  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  23.29 
 
 
1342 aa  84.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  22.5 
 
 
1184 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  23.22 
 
 
1321 aa  81.6  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  21.76 
 
 
950 aa  81.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  20.96 
 
 
1210 aa  80.9  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  23.86 
 
 
1354 aa  74.3  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  21.63 
 
 
1375 aa  74.3  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  21.63 
 
 
1022 aa  73.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  25.82 
 
 
1250 aa  73.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  21.56 
 
 
1712 aa  72.8  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  32.39 
 
 
1612 aa  72.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  31.85 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  25.54 
 
 
1250 aa  70.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.87 
 
 
1058 aa  70.5  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  24.12 
 
 
1041 aa  70.1  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  25 
 
 
1581 aa  69.3  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  23.69 
 
 
1338 aa  68.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  22.75 
 
 
1319 aa  67.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  23.78 
 
 
1333 aa  66.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  23.03 
 
 
1441 aa  66.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  22.31 
 
 
1339 aa  65.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  24.61 
 
 
1020 aa  65.1  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  20.95 
 
 
1373 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  20 
 
 
1098 aa  63.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  22.49 
 
 
1306 aa  63.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  20.55 
 
 
1219 aa  63.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  21.04 
 
 
926 aa  63.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  25.98 
 
 
1277 aa  62.8  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  21 
 
 
974 aa  62.4  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  21.01 
 
 
1322 aa  61.6  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  29.17 
 
 
522 aa  61.6  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  20.87 
 
 
1331 aa  61.6  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  21.37 
 
 
1459 aa  60.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  24.86 
 
 
1358 aa  60.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  22.81 
 
 
1278 aa  60.1  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  22.43 
 
 
1461 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  27.78 
 
 
1336 aa  59.3  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  31.03 
 
 
595 aa  59.3  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  23.44 
 
 
539 aa  59.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  23.63 
 
 
1497 aa  58.9  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  21.38 
 
 
1343 aa  58.5  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  30.97 
 
 
423 aa  58.2  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  22.79 
 
 
1339 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  22.79 
 
 
1339 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  26.85 
 
 
493 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  22.98 
 
 
1409 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  21.5 
 
 
1422 aa  57.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  35.8 
 
 
816 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  27.1 
 
 
1355 aa  56.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  26.4 
 
 
792 aa  56.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  26.09 
 
 
563 aa  55.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  21.74 
 
 
1363 aa  55.5  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  21.34 
 
 
1346 aa  55.1  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  21.24 
 
 
527 aa  55.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  28.93 
 
 
846 aa  54.7  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  21.9 
 
 
836 aa  54.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  25.81 
 
 
573 aa  54.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  24.44 
 
 
652 aa  54.3  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  22.22 
 
 
1290 aa  54.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  21.43 
 
 
1282 aa  53.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  24.66 
 
 
1452 aa  53.5  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  24.65 
 
 
534 aa  54.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  21.19 
 
 
629 aa  52.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  22.67 
 
 
1243 aa  52  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  24.62 
 
 
1365 aa  52  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  21.86 
 
 
1425 aa  51.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  22.39 
 
 
1332 aa  51.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  23.51 
 
 
526 aa  51.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  25.83 
 
 
1195 aa  51.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>