157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2210 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  100 
 
 		 836 aa  1678    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  33.07 
 
 		 1036 aa  416  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  32.1 
 
 		 995 aa  403  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  30 
 
 		 1058 aa  308  3e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  32.59 
 
 		 950 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  27.37 
 
 		 1020 aa  258  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  26.86 
 
 		 795 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.54 
 
 		 974 aa  157  9e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  31.08 
 
 		 1432 aa  157  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  28.35 
 
 		 493 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  27.42 
 
 		 416 aa  122  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  22.17 
 
 		 629 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1612 aa  109  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1177 aa  108  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  24.84 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  27.75 
 
 		 1159 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  29.09 
 
 		 1041 aa  101  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  30.86 
 
 		 792 aa  95.9  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  24.42 
 
 		 1132 aa  94.7  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  20.44 
 
 		 684 aa  92  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1195 aa  91.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.2 
 
 		 1076 aa  89.7  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  23.87 
 
 		 1170 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  21.87 
 
 		 1147 aa  85.5  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  20.57 
 
 		 518 aa  84.7  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1125 aa  82.8  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1178 aa  82.8  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1426 aa  79.7  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1120 aa  79  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  31.75 
 
 		 816 aa  77.8  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1154 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  20.38 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  22.36 
 
 		 652 aa  74.7  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  20.39 
 
 		 562 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  25.68 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1209 aa  71.2  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  21.7 
 
 		 1257 aa  71.2  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  32.62 
 
 		 1104 aa  70.9  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  24.86 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1299 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1209 aa  70.1  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  20.58 
 
 		 1282 aa  69.3  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  33.81 
 
 		 1338 aa  68.2  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  20.25 
 
 		 1241 aa  65.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  22.12 
 
 		 1256 aa  64.3  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1347 aa  63.9  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1365 aa  64.3  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  21.22 
 
 		 1252 aa  63.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0993  hypothetical protein  21.86 
 
 		 826 aa  63.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  22.32 
 
 		 1189 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  28.19 
 
 		 1244 aa  62  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1366 aa  61.2  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  37.63 
 
 		 882 aa  61.2  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  24.24 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1579 aa  60.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1140 aa  60.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.59 
 
 		 1002 aa  59.7  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0121  putative DNA methylase  22.64 
 
 		 1022 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  21.58 
 
 		 570 aa  59.3  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  18.95 
 
 		 1233 aa  59.3  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1346 aa  58.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  28.57 
 
 		 1089 aa  58.5  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  29.17 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1184 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  27.05 
 
 		 389 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  21.41 
 
 		 612 aa  56.6  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  21.91 
 
 		 673 aa  56.6  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1131 aa  55.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  23.94 
 
 		 908 aa  55.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1338 aa  55.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  29.35 
 
 		 826 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  21.9 
 
 		 1194 aa  54.7  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  18.49 
 
 		 1239 aa  54.3  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  28.99 
 
 		 838 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1243 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1290 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1231 aa  53.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1440 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  34.91 
 
 		 1088 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1347 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1581 aa  52.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  21.96 
 
 		 1298 aa  53.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  24.8 
 
 		 1277 aa  53.1  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  24.88 
 
 		 1343 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  22.13 
 
 		 1038 aa  52.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1459 aa  52.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1452 aa  52.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1557 aa  52.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  25 
 
 		 1461 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  27.86 
 
 		 574 aa  52  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1039 aa  52  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  25.5 
 
 		 1278 aa  52  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1339 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1339 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  25.74 
 
 		 846 aa  51.2  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  20.23 
 
 		 1222 aa  51.2  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  27.14 
 
 		 574 aa  51.2  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.14 
 
 		 462 aa  50.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  23.02 
 
 		 746 aa  50.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  41.38 
 
 		 1282 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>