70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02930 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  38.58 
 
 		 1174 aa  752    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  100 
 
 		 1131 aa  2333    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  74.65 
 
 		 1140 aa  1695    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  38.14 
 
 		 1171 aa  809    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  39.61 
 
 		 1162 aa  819    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  34.04 
 
 		 1160 aa  640    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  35.56 
 
 		 1183 aa  687    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  37.96 
 
 		 1182 aa  806    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  33.56 
 
 		 1144 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  32.67 
 
 		 1180 aa  565  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  31.33 
 
 		 1167 aa  527  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  31.21 
 
 		 1205 aa  528  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  30.62 
 
 		 1219 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  36.29 
 
 		 1218 aa  362  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1270 aa  341  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  37.48 
 
 		 612 aa  333  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  39.21 
 
 		 332 aa  252  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1241 aa  218  8e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1359 aa  215  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1324 aa  212  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1425 aa  205  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1125 aa  199  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1430 aa  184  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1497 aa  181  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1484 aa  171  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  26.66 
 
 		 1141 aa  140  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1154 aa  132  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  22.53 
 
 		 706 aa  132  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1174 aa  132  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1154 aa  128  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1162 aa  127  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1107 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  22.62 
 
 		 882 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1326 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1129 aa  117  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  24.96 
 
 		 731 aa  113  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.4 
 
 		 950 aa  76.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.87 
 
 		 1058 aa  75.9  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.36 
 
 		 995 aa  75.1  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  26.74 
 
 		 1239 aa  69.7  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  38.37 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  25.72 
 
 		 300 aa  67.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  25.68 
 
 		 288 aa  67  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  28.65 
 
 		 974 aa  63.2  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1282 aa  59.7  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2491  hypothetical protein  38.83 
 
 		 106 aa  59.7  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1231 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1104 aa  56.6  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  41.1 
 
 		 416 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.07 
 
 		 836 aa  55.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1195 aa  55.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  20.79 
 
 		 1020 aa  54.3  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1209 aa  54.3  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  39.74 
 
 		 929 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1209 aa  52.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  21.87 
 
 		 1177 aa  52.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  27.46 
 
 		 1089 aa  48.9  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2238  hypothetical protein  26.55 
 
 		 389 aa  48.5  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0102712 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  25.79 
 
 		 481 aa  47.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  20 
 
 		 1041 aa  47.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  30.43 
 
 		 1358 aa  47.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1426 aa  47  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  25.53 
 
 		 1252 aa  46.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  24.29 
 
 		 684 aa  45.8  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  31.52 
 
 		 1002 aa  45.8  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  29.79 
 
 		 746 aa  45.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  23.1 
 
 		 1132 aa  45.1  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0098  hypothetical protein  30.37 
 
 		 455 aa  45.1  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340273  hitchhiker  0.000211537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  25.58 
 
 		 795 aa  45.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  38.81 
 
 		 918 aa  45.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>