160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2355 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 1038 aa  2139    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1016 aa  412  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0121  putative DNA methylase  30.46 
 
 		 1022 aa  342  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.71 
 
 		 1002 aa  247  6.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  26.88 
 
 		 746 aa  156  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  22.93 
 
 		 908 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1800  hypothetical protein  30.52 
 
 		 372 aa  112  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.48 
 
 		 995 aa  79.7  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  24.64 
 
 		 950 aa  79  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  21.95 
 
 		 1058 aa  79  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  33.82 
 
 		 1189 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1209 aa  76.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1282 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  23.24 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  35.66 
 
 		 1195 aa  68.6  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1233 aa  68.2  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  21.85 
 
 		 489 aa  67.4  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  25.1 
 
 		 488 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  32.59 
 
 		 1222 aa  66.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  25.1 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  23.12 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  22.63 
 
 		 974 aa  65.5  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  22.77 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  30.09 
 
 		 1219 aa  64.7  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1338 aa  64.7  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  22.77 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  25.56 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  25.43 
 
 		 490 aa  63.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  25.86 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  21.85 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  24.49 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  23.58 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  20.93 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1457  type I restriction-modification system, M subunit, putative  23.86 
 
 		 684 aa  62  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  24.68 
 
 		 493 aa  62  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  23.05 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  28.57 
 
 		 1358 aa  61.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  29.88 
 
 		 1338 aa  60.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  34.48 
 
 		 1319 aa  60.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  27.78 
 
 		 1055 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  38.39 
 
 		 1306 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  30.41 
 
 		 1354 aa  58.5  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1173 aa  58.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.32 
 
 		 1020 aa  58.2  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  22.47 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  33.55 
 
 		 1321 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  22.39 
 
 		 570 aa  57.4  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  21.75 
 
 		 500 aa  57.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1365 aa  57.4  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  20.83 
 
 		 1036 aa  57.4  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  32.23 
 
 		 1322 aa  56.6  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2728  putative DNA methylase  31.72 
 
 		 1208 aa  57  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1231 aa  56.6  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  25.22 
 
 		 1041 aa  56.6  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  21.41 
 
 		 489 aa  56.6  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  21.41 
 
 		 489 aa  56.6  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  31.9 
 
 		 509 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  22.01 
 
 		 554 aa  55.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1459 aa  55.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1093 aa  55.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  25.1 
 
 		 775 aa  55.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  22.13 
 
 		 479 aa  55.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  27.44 
 
 		 1336 aa  54.7  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  27.27 
 
 		 1321 aa  54.3  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  33.94 
 
 		 1239 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  36.3 
 
 		 1339 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  23.44 
 
 		 416 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  27.22 
 
 		 1331 aa  53.9  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  36.3 
 
 		 1339 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1422 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  32.65 
 
 		 510 aa  53.1  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  24.79 
 
 		 537 aa  52.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1022 aa  53.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  25.53 
 
 		 485 aa  53.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  28.15 
 
 		 1712 aa  52.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1243 aa  53.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1353 aa  52.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.13 
 
 		 836 aa  52.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.48 
 
 		 502 aa  52.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  20.43 
 
 		 489 aa  52.4  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.71 
 
 		 703 aa  51.6  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  22.62 
 
 		 633 aa  51.6  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1342 aa  51.6  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 492 aa  51.6  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  22.51 
 
 		 553 aa  50.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1751 aa  51.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  24.44 
 
 		 605 aa  50.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  32.87 
 
 		 1440 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  33.57 
 
 		 1363 aa  50.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  24.58 
 
 		 1170 aa  50.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1303  N-6 DNA methylase  31.67 
 
 		 529 aa  49.7  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  27.01 
 
 		 1355 aa  49.7  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  22.3 
 
 		 553 aa  49.7  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1347 aa  49.7  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1579 aa  49.3  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1347 aa  49.3  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  38.81 
 
 		 1430 aa  48.9  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  28.8 
 
 		 595 aa  48.9  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.83 
 
 		 517 aa  48.9  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  21.2 
 
 		 505 aa  48.5  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>