139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1457 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  56.41 
 
 		 1257 aa  1302    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  54.35 
 
 		 1244 aa  1195    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  69.92 
 
 		 1252 aa  1692    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  100 
 
 		 1256 aa  2512    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  40.52 
 
 		 1186 aa  546  1e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1299 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  36.33 
 
 		 1194 aa  462  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  49.9 
 
 		 1058 aa  426  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  31.11 
 
 		 652 aa  232  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  31.28 
 
 		 1020 aa  207  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1177 aa  198  6e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1209 aa  179  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  25.66 
 
 		 1076 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1154 aa  164  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  23.77 
 
 		 1132 aa  148  6e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  25.19 
 
 		 1089 aa  139  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  26.34 
 
 		 1159 aa  134  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  25.05 
 
 		 995 aa  134  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1178 aa  134  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1120 aa  121  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1612 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1298 aa  121  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1104 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1036 aa  110  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  22.58 
 
 		 1170 aa  110  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1184 aa  101  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1338 aa  101  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1210 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1147 aa  99.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  21.66 
 
 		 1426 aa  94  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1039 aa  91.7  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.75 
 
 		 974 aa  89.4  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1250 aa  85.1  0.000000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1250 aa  83.6  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  22.62 
 
 		 1712 aa  83.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  23.7 
 
 		 838 aa  82.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1088 aa  82.4  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  32.21 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  23.94 
 
 		 882 aa  80.1  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  27.6 
 
 		 1041 aa  79  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1342 aa  77.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  29.28 
 
 		 416 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  20.4 
 
 		 1422 aa  77.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1321 aa  76.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  20.16 
 
 		 1290 aa  74.3  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  23.7 
 
 		 1278 aa  74.7  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  19.84 
 
 		 1432 aa  74.3  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  22.64 
 
 		 1354 aa  73.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  20.04 
 
 		 1282 aa  73.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  24.88 
 
 		 1336 aa  73.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1375 aa  73.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1022 aa  73.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1339 aa  72.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1339 aa  72.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  21.37 
 
 		 1331 aa  71.6  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1441 aa  70.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  22.74 
 
 		 1322 aa  71.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  21.7 
 
 		 1459 aa  69.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1452 aa  69.3  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1373 aa  69.3  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  25.41 
 
 		 1277 aa  69.3  0.0000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1461 aa  68.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1581 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  20.98 
 
 		 1339 aa  68.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  28.67 
 
 		 950 aa  68.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1409 aa  67.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1346 aa  66.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  19.91 
 
 		 518 aa  66.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  23.81 
 
 		 1319 aa  66.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  22.28 
 
 		 1425 aa  65.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1440 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.2 
 
 		 836 aa  63.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1353 aa  63.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1333 aa  63.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  21.09 
 
 		 1347 aa  62.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  21 
 
 		 1219 aa  62.4  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1363 aa  61.6  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  25 
 
 		 1306 aa  61.6  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  20.69 
 
 		 570 aa  60.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  20.8 
 
 		 1347 aa  61.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  23.88 
 
 		 1343 aa  61.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  21.85 
 
 		 1243 aa  60.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  21.43 
 
 		 1318 aa  60.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  20.92 
 
 		 1322 aa  59.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  22.62 
 
 		 694 aa  59.3  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1338 aa  57.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  22.49 
 
 		 1338 aa  57.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  26.03 
 
 		 527 aa  57.8  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1365 aa  57.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  26.44 
 
 		 846 aa  57.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1640 aa  57  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  21.47 
 
 		 1098 aa  55.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  28.57 
 
 		 423 aa  55.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  27.68 
 
 		 562 aa  55.5  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1642 aa  55.1  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.65 
 
 		 1640 aa  55.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  30.53 
 
 		 557 aa  54.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  25 
 
 		 512 aa  54.3  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  28.97 
 
 		 629 aa  55.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1644 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>