147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3412 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  100 
 
 		 1159 aa  2403    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  34.86 
 
 		 1089 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  37.01 
 
 		 1170 aa  327  9e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  42.29 
 
 		 1120 aa  315  3.9999999999999997e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  38.25 
 
 		 1178 aa  307  7e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  34.39 
 
 		 1177 aa  289  2e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  38.26 
 
 		 1132 aa  275  3e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  32.31 
 
 		 1147 aa  271  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1299 aa  270  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  35.83 
 
 		 1244 aa  266  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  38.9 
 
 		 1076 aa  265  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  33.87 
 
 		 1154 aa  245  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  33.73 
 
 		 1209 aa  240  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  33.93 
 
 		 1257 aa  239  3e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  34.33 
 
 		 995 aa  238  5.0000000000000005e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1210 aa  237  8e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  33.12 
 
 		 1036 aa  221  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1039 aa  202  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1338 aa  196  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1184 aa  193  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1426 aa  184  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  30.59 
 
 		 974 aa  184  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1104 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  25.88 
 
 		 1432 aa  173  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  45.75 
 
 		 247 aa  156  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  23.42 
 
 		 1252 aa  155  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1612 aa  134  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  26.72 
 
 		 1256 aa  132  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  21.14 
 
 		 1194 aa  126  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1298 aa  125  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  26.39 
 
 		 1058 aa  115  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  28.02 
 
 		 410 aa  114  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.75 
 
 		 836 aa  102  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  24.7 
 
 		 882 aa  101  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  26.25 
 
 		 1186 aa  101  8e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1347 aa  95.5  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  29.67 
 
 		 838 aa  94.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  20.97 
 
 		 1282 aa  92.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1321 aa  92.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  33.18 
 
 		 416 aa  92  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  21.92 
 
 		 652 aa  90.9  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1363 aa  89.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1452 aa  87  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  20.69 
 
 		 1290 aa  87  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1440 aa  85.1  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1088 aa  84.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  22.82 
 
 		 1343 aa  81.6  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1346 aa  81.6  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.71 
 
 		 950 aa  81.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  25.3 
 
 		 1318 aa  80.1  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  22.03 
 
 		 1366 aa  79.3  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1347 aa  78.2  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1461 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  24.19 
 
 		 1355 aa  77.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  22.78 
 
 		 629 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1422 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  21.91 
 
 		 1020 aa  74.7  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  21.61 
 
 		 518 aa  74.7  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1338 aa  72.8  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1441 aa  72  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  25.06 
 
 		 1358 aa  71.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  21.52 
 
 		 557 aa  69.7  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  20.85 
 
 		 1353 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  22.33 
 
 		 1041 aa  69.3  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1339 aa  69.3  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  22.66 
 
 		 570 aa  68.2  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  29.06 
 
 		 694 aa  67.8  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  22.61 
 
 		 1331 aa  67.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  23.48 
 
 		 493 aa  67.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  23.97 
 
 		 1322 aa  68.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  21.19 
 
 		 1342 aa  67.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  20.58 
 
 		 562 aa  65.1  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  25.23 
 
 		 1354 aa  63.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  19.81 
 
 		 1339 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  19.81 
 
 		 1339 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  34.09 
 
 		 792 aa  61.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  22.89 
 
 		 1336 aa  61.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  22.41 
 
 		 1321 aa  60.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  27.84 
 
 		 595 aa  60.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  22.51 
 
 		 1306 aa  60.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1243 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  25 
 
 		 1333 aa  58.9  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  22.22 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  27.69 
 
 		 846 aa  58.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  36.27 
 
 		 816 aa  58.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1174 aa  57.4  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  27.56 
 
 		 404 aa  57  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  23.42 
 
 		 934 aa  57  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1171 aa  57  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  27.22 
 
 		 1712 aa  57  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  20.91 
 
 		 1278 aa  57  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  26.67 
 
 		 478 aa  56.2  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  28.31 
 
 		 504 aa  55.8  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  27.72 
 
 		 524 aa  55.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  20.4 
 
 		 1231 aa  55.8  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  28.74 
 
 		 1055 aa  55.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1373 aa  55.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1581 aa  55.1  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1250 aa  54.3  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  25.33 
 
 		 423 aa  54.3  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>