88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2393 on replicon NC_009516
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1309  methylase  39.45 
 
 		 933 aa  700    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  39.89 
 
 		 908 aa  679    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  38.58 
 
 		 909 aa  639    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  36.98 
 
 		 928 aa  646    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  100 
 
 		 934 aa  1955    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  37.12 
 
 		 937 aa  625  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  38.16 
 
 		 919 aa  588  1e-166  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  37.93 
 
 		 871 aa  531  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  33.3 
 
 		 914 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  34.73 
 
 		 912 aa  501  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  35.67 
 
 		 955 aa  496  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  32.83 
 
 		 941 aa  487  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  37.24 
 
 		 929 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  35.33 
 
 		 916 aa  479  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  35.12 
 
 		 934 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  33.41 
 
 		 932 aa  439  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  31.77 
 
 		 926 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  30.73 
 
 		 928 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  30.72 
 
 		 928 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  30.8 
 
 		 926 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  30.99 
 
 		 918 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  31.27 
 
 		 921 aa  382  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  28.52 
 
 		 909 aa  351  4e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  28.47 
 
 		 929 aa  335  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  24.84 
 
 		 978 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  27.9 
 
 		 622 aa  211  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  26.2 
 
 		 925 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1173 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1018 aa  161  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1188 aa  161  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1184 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1151 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  22 
 
 		 1170 aa  146  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  25.04 
 
 		 918 aa  144  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  22.78 
 
 		 1186 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  22.75 
 
 		 973 aa  141  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1154 aa  139  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  24.5 
 
 		 621 aa  127  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  23.48 
 
 		 869 aa  88.2  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1339 aa  86.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.87 
 
 		 974 aa  70.5  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1298 aa  63.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1243 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  21.34 
 
 		 1041 aa  61.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1422 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1321 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  23.42 
 
 		 1159 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  20.43 
 
 		 478 aa  55.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  23.69 
 
 		 416 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  30.46 
 
 		 1319 aa  54.7  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1353 aa  54.3  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  26.55 
 
 		 1338 aa  53.5  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1333 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1459 aa  52.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  28.66 
 
 		 1322 aa  52  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  28.16 
 
 		 1306 aa  51.6  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1039 aa  51.6  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  22.69 
 
 		 950 aa  51.2  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  23.75 
 
 		 1089 aa  50.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  20.39 
 
 		 1347 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  37 
 
 		 97 aa  50.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1373 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1210 aa  48.9  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  24.39 
 
 		 1354 aa  48.9  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  26.32 
 
 		 1055 aa  48.5  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  23.12 
 
 		 1219 aa  48.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  23.67 
 
 		 792 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1425 aa  48.1  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  20.45 
 
 		 1432 aa  48.1  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  19.41 
 
 		 1076 aa  47.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1282 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  18.64 
 
 		 504 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  24.05 
 
 		 1358 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  24.54 
 
 		 1318 aa  46.6  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  21.98 
 
 		 995 aa  47  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  22.99 
 
 		 1132 aa  47  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1290 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  30.84 
 
 		 1125 aa  45.8  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  25.31 
 
 		 1331 aa  45.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  25.38 
 
 		 1170 aa  45.8  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  19.87 
 
 		 1342 aa  45.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  27.75 
 
 		 1321 aa  45.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  23.53 
 
 		 1712 aa  45.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  20.81 
 
 		 694 aa  45.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1201  N-6 DNA methylase  22.61 
 
 		 499 aa  44.7  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  27.59 
 
 		 795 aa  44.3  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1365 aa  44.3  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1338 aa  44.3  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>