77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2740 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  54.16 
 
 		 1151 aa  1101    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  58.21 
 
 		 1154 aa  1173    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  100 
 
 		 1018 aa  2076    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  48.1 
 
 		 1188 aa  967    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  60.49 
 
 		 1173 aa  1254    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  48.23 
 
 		 1184 aa  957    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  47.97 
 
 		 869 aa  662    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  58.37 
 
 		 1170 aa  1174    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  49.34 
 
 		 1186 aa  920    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 918 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  32.22 
 
 		 925 aa  432  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  29.9 
 
 		 973 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  31.71 
 
 		 621 aa  292  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  43.85 
 
 		 430 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  25.29 
 
 		 978 aa  253  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3224  hypothetical protein  45.1 
 
 		 332 aa  234  7.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  25.98 
 
 		 928 aa  182  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  23.95 
 
 		 909 aa  169  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  22.14 
 
 		 934 aa  162  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  24.06 
 
 		 933 aa  162  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  24.13 
 
 		 908 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  23.73 
 
 		 919 aa  154  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  26.85 
 
 		 937 aa  151  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  24.16 
 
 		 871 aa  145  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1346 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  22.7 
 
 		 955 aa  136  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  26.17 
 
 		 916 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  22.92 
 
 		 934 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  23.58 
 
 		 941 aa  129  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1282 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  21.67 
 
 		 918 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1440 aa  125  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  24.36 
 
 		 914 aa  124  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1363 aa  124  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  22.68 
 
 		 929 aa  124  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  23.86 
 
 		 928 aa  122  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1409 aa  121  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  22.82 
 
 		 932 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  24.11 
 
 		 912 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1365 aa  117  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.61 
 
 		 929 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1339 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1339 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1347 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1342 aa  108  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  22.18 
 
 		 926 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1441 aa  105  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  28.67 
 
 		 536 aa  105  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1347 aa  104  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  26.31 
 
 		 1290 aa  104  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1353 aa  104  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.41 
 
 		 926 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1321 aa  99.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1461 aa  98.6  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  22.34 
 
 		 928 aa  97.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1452 aa  96.3  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1243 aa  93.6  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  24.53 
 
 		 921 aa  90.5  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  34.13 
 
 		 333 aa  90.1  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1366 aa  90.1  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.55 
 
 		 909 aa  86.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  26.91 
 
 		 974 aa  82  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  23.67 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  20.55 
 
 		 1041 aa  57.4  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1338 aa  55.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  26.13 
 
 		 1319 aa  54.7  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  20.63 
 
 		 1002 aa  54.3  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.11 
 
 		 1432 aa  53.5  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1022 aa  52.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1298 aa  52.4  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1426 aa  51.6  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  23.13 
 
 		 1058 aa  50.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  32.73 
 
 		 1184 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1359 aa  49.3  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1339 aa  49.3  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  25.15 
 
 		 1159 aa  45.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  34.51 
 
 		 792 aa  44.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>