81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1365 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  43.48 
 
 		 973 aa  756    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  47.42 
 
 		 918 aa  842    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  100 
 
 		 925 aa  1910    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  41.88 
 
 		 621 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  31.44 
 
 		 1154 aa  442  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1018 aa  438  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1173 aa  439  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1151 aa  428  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  31.08 
 
 		 1186 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1188 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1184 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1170 aa  373  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  30.68 
 
 		 869 aa  307  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  28.35 
 
 		 978 aa  261  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  26.65 
 
 		 909 aa  228  6e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2486  hypothetical protein  88.89 
 
 		 123 aa  205  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.658764  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  26.39 
 
 		 934 aa  205  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  25.18 
 
 		 908 aa  197  9e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  25.88 
 
 		 937 aa  194  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  27.34 
 
 		 871 aa  189  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  25.92 
 
 		 914 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  24.17 
 
 		 928 aa  178  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  25.36 
 
 		 912 aa  177  7e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  25.81 
 
 		 916 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  25.29 
 
 		 955 aa  173  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  25.48 
 
 		 934 aa  170  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  28.21 
 
 		 933 aa  169  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  36.09 
 
 		 333 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  26.46 
 
 		 919 aa  166  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  25.83 
 
 		 929 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1346 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  30.36 
 
 		 430 aa  144  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1363 aa  142  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  23.92 
 
 		 941 aa  141  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  29 
 
 		 1339 aa  140  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  29 
 
 		 1339 aa  140  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.49 
 
 		 926 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1321 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1347 aa  137  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1342 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1347 aa  134  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1243 aa  132  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.54 
 
 		 918 aa  132  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1409 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  27.83 
 
 		 926 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  23.55 
 
 		 932 aa  122  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1353 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1365 aa  121  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  23.83 
 
 		 928 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  29.1 
 
 		 909 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1366 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  23.31 
 
 		 928 aa  117  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1452 aa  116  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1440 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  23.08 
 
 		 921 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.15 
 
 		 929 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1461 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  26.45 
 
 		 536 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1282 aa  107  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1441 aa  96.3  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1290 aa  87.8  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.55 
 
 		 974 aa  79  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3224  hypothetical protein  30.4 
 
 		 332 aa  60.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.15 
 
 		 1041 aa  57.8  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.93 
 
 		 1076 aa  55.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  19.33 
 
 		 1058 aa  54.7  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  23.23 
 
 		 512 aa  54.7  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1298 aa  49.3  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  41.03 
 
 		 309 aa  49.3  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  25.31 
 
 		 792 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1022 aa  48.5  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1373 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  42.86 
 
 		 838 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1039 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  22.79 
 
 		 612 aa  46.2  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  27.52 
 
 		 652 aa  45.8  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1210 aa  45.8  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1209 aa  45.8  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1324 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1339 aa  45.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  22.62 
 
 		 1038 aa  44.7  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>