65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0416 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  100 
 
 		 536 aa  1107    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  51.66 
 
 		 1346 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  50.51 
 
 		 1440 aa  473  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  46.69 
 
 		 1409 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  45.22 
 
 		 1363 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  47.15 
 
 		 1347 aa  402  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  43.65 
 
 		 1365 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  44.06 
 
 		 1347 aa  389  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  42.68 
 
 		 1339 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  42.68 
 
 		 1339 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  37.66 
 
 		 1282 aa  343  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  38.45 
 
 		 1461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  38.52 
 
 		 1290 aa  330  6e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  40.51 
 
 		 1243 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  35.97 
 
 		 1452 aa  309  6.999999999999999e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  35.27 
 
 		 1366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  37.79 
 
 		 1342 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  34.18 
 
 		 1321 aa  257  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1441 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1353 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  26.89 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  27.16 
 
 		 978 aa  134  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1173 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1151 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  28.7 
 
 		 918 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  30 
 
 		 1170 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  26.45 
 
 		 925 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1184 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1018 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  27.01 
 
 		 1186 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1154 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  24.51 
 
 		 869 aa  97.8  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1188 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  28.35 
 
 		 973 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  29.24 
 
 		 430 aa  88.6  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  25.38 
 
 		 926 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  30 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  24.54 
 
 		 928 aa  63.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  24.5 
 
 		 995 aa  63.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  25.06 
 
 		 916 aa  61.6  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1036 aa  58.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  22.09 
 
 		 928 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  20.28 
 
 		 933 aa  55.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  21.93 
 
 		 926 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  21.89 
 
 		 871 aa  54.3  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  19.53 
 
 		 921 aa  53.5  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  23.11 
 
 		 955 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  20.42 
 
 		 929 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  21.18 
 
 		 908 aa  52.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  34 
 
 		 1299 aa  50.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  25.44 
 
 		 934 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  21.06 
 
 		 909 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1426 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  22.12 
 
 		 928 aa  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  20.6 
 
 		 929 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1178 aa  47.4  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  28.91 
 
 		 621 aa  47  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  21.67 
 
 		 941 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  21.93 
 
 		 937 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  20.27 
 
 		 622 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1184 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  34.25 
 
 		 1041 aa  44.3  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1147 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  20 
 
 		 909 aa  43.5  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  21.96 
 
 		 1338 aa  43.5  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>