94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2985 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  48.08 
 
 		 1151 aa  1100    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  60.49 
 
 		 1018 aa  1239    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  51.85 
 
 		 1154 aa  1185    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  100 
 
 		 1173 aa  2415    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  46.24 
 
 		 1184 aa  1030    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  48.14 
 
 		 1186 aa  899    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  51.91 
 
 		 1170 aa  1176    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  43.1 
 
 		 869 aa  687    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  44.07 
 
 		 1188 aa  977    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  32.33 
 
 		 918 aa  458  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  30.19 
 
 		 925 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  28.94 
 
 		 973 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  41.94 
 
 		 430 aa  320  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  30.3 
 
 		 621 aa  299  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  25.92 
 
 		 978 aa  250  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3224  hypothetical protein  46.97 
 
 		 332 aa  248  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  22.03 
 
 		 909 aa  172  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  22.02 
 
 		 934 aa  166  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  24.49 
 
 		 919 aa  166  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  25.29 
 
 		 871 aa  164  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  22.79 
 
 		 912 aa  163  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  25.36 
 
 		 928 aa  163  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  24.14 
 
 		 937 aa  162  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1353 aa  158  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  24.43 
 
 		 955 aa  156  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1346 aa  154  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  21.57 
 
 		 908 aa  152  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  27.42 
 
 		 928 aa  144  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  23.36 
 
 		 932 aa  144  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  24.84 
 
 		 926 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1440 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1282 aa  138  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  26.52 
 
 		 916 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1409 aa  136  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1363 aa  136  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.92 
 
 		 926 aa  135  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  24.68 
 
 		 928 aa  135  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  24.47 
 
 		 933 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1366 aa  133  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  45.81 
 
 		 333 aa  132  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  30.25 
 
 		 536 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.64 
 
 		 929 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1342 aa  128  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.01 
 
 		 918 aa  122  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  25.06 
 
 		 914 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1347 aa  119  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1441 aa  118  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1365 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1339 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1290 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1339 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1347 aa  112  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1321 aa  109  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  26.58 
 
 		 929 aa  108  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  27.24 
 
 		 934 aa  107  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  24.76 
 
 		 921 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1243 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.65 
 
 		 909 aa  100  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1461 aa  98.6  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1452 aa  92.8  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  25.18 
 
 		 941 aa  90.1  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  23.38 
 
 		 974 aa  77.4  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  20.22 
 
 		 512 aa  63.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  28.05 
 
 		 1432 aa  62  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  24.46 
 
 		 1038 aa  58.9  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1339 aa  58.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1184 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1298 aa  55.1  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1422 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  27.63 
 
 		 1076 aa  54.3  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  26.8 
 
 		 1354 aa  52.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1241 aa  52  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  28.62 
 
 		 1239 aa  51.6  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  29 
 
 		 1104 aa  51.6  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  26.67 
 
 		 1319 aa  50.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  20 
 
 		 1002 aa  51.2  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1338 aa  50.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1022 aa  50.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  18.93 
 
 		 1041 aa  50.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1231 aa  50.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1359 aa  49.3  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  28.88 
 
 		 1336 aa  49.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1333 aa  48.5  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.1 
 
 		 1058 aa  48.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  20.34 
 
 		 1177 aa  47.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1195 aa  47.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  21.91 
 
 		 950 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1373 aa  45.8  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  27.06 
 
 		 1306 aa  45.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  26.42 
 
 		 1159 aa  45.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  25.15 
 
 		 826 aa  45.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  28.26 
 
 		 1338 aa  45.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1430 aa  45.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  20.94 
 
 		 478 aa  44.7  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>