92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_7058 on replicon NC_010374
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  43.93 
 
 		 1173 aa  976    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  42.57 
 
 		 1151 aa  904    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  100 
 
 		 1188 aa  2446    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  43.77 
 
 		 1184 aa  899    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  46.86 
 
 		 1186 aa  840    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  42.95 
 
 		 1170 aa  892    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  47.88 
 
 		 869 aa  783    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  48.1 
 
 		 1018 aa  954    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  43.2 
 
 		 1154 aa  943    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  30.17 
 
 		 918 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  29.14 
 
 		 925 aa  377  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3224  hypothetical protein  63.57 
 
 		 332 aa  362  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  28 
 
 		 973 aa  340  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  29.99 
 
 		 621 aa  259  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  36.64 
 
 		 430 aa  249  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  25.09 
 
 		 978 aa  209  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  22.46 
 
 		 934 aa  161  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  26.79 
 
 		 909 aa  154  8.999999999999999e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1346 aa  151  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  23.77 
 
 		 919 aa  149  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  25.54 
 
 		 871 aa  146  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  22.25 
 
 		 912 aa  144  7e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1363 aa  142  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  22.87 
 
 		 908 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  22.79 
 
 		 928 aa  136  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  22.67 
 
 		 937 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  22.95 
 
 		 933 aa  135  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1440 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  24.67 
 
 		 916 aa  132  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1353 aa  131  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1365 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  23.62 
 
 		 929 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  23.26 
 
 		 955 aa  122  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  22.25 
 
 		 934 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  26.68 
 
 		 1347 aa  116  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1409 aa  115  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1342 aa  115  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  23.25 
 
 		 932 aa  115  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  25.52 
 
 		 914 aa  114  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1441 aa  114  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1461 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  23.13 
 
 		 928 aa  111  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.44 
 
 		 926 aa  107  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.78 
 
 		 929 aa  106  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1321 aa  105  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1347 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  22.02 
 
 		 928 aa  103  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  22.12 
 
 		 926 aa  103  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.63 
 
 		 918 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  24.08 
 
 		 536 aa  100  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1282 aa  97.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  25 
 
 		 1243 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.73 
 
 		 909 aa  94.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1366 aa  93.2  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  22.02 
 
 		 941 aa  92  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  32.7 
 
 		 333 aa  87  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1339 aa  85.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1339 aa  85.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1452 aa  85.1  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1290 aa  84.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  23.26 
 
 		 921 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  26.15 
 
 		 974 aa  68.6  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  19.84 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  28.28 
 
 		 1432 aa  63.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1338 aa  59.3  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1184 aa  57  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  22.19 
 
 		 1041 aa  56.2  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1022 aa  55.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1339 aa  53.5  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1298 aa  53.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1359 aa  52.8  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  32.85 
 
 		 1373 aa  52.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1332 aa  52  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  22.73 
 
 		 1186 aa  51.6  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1104 aa  51.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1333 aa  50.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  24.56 
 
 		 1278 aa  50.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  24.2 
 
 		 838 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  21.59 
 
 		 1170 aa  48.5  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  23.79 
 
 		 1277 aa  48.5  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  26.67 
 
 		 1132 aa  48.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1218 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  35.37 
 
 		 1241 aa  47.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  21.2 
 
 		 1058 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1422 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  26.95 
 
 		 1338 aa  46.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  19.94 
 
 		 1426 aa  45.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1425 aa  45.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  20.7 
 
 		 1002 aa  45.4  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  24.77 
 
 		 1219 aa  45.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  24.14 
 
 		 1159 aa  45.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2486  hypothetical protein  26.72 
 
 		 123 aa  45.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.658764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>