147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2163 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  100 
 
 
1104 aa  2256    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  26.21 
 
 
1298 aa  189  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  27.88 
 
 
1177 aa  177  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  25.52 
 
 
1159 aa  175  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  27.44 
 
 
1178 aa  174  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  23.04 
 
 
1147 aa  149  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  25.04 
 
 
1089 aa  142  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  26.18 
 
 
1120 aa  140  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  25.17 
 
 
1210 aa  140  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  25.31 
 
 
882 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  25.29 
 
 
1209 aa  134  9e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  32.17 
 
 
838 aa  132  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  24.85 
 
 
1170 aa  129  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  24.96 
 
 
1184 aa  126  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  23.52 
 
 
1076 aa  120  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  25.56 
 
 
1256 aa  120  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.18 
 
 
1194 aa  119  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  22.81 
 
 
1154 aa  119  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  22.85 
 
 
1186 aa  119  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  22.18 
 
 
1132 aa  119  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  28.19 
 
 
1088 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  23.04 
 
 
1244 aa  111  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  22.67 
 
 
1257 aa  110  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  29.22 
 
 
974 aa  110  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  26.55 
 
 
1039 aa  110  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  27.99 
 
 
410 aa  110  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  23.39 
 
 
1252 aa  109  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  23.2 
 
 
1338 aa  110  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  26.9 
 
 
995 aa  105  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  29.41 
 
 
1041 aa  100  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  24.79 
 
 
1036 aa  93.6  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  22.78 
 
 
1299 aa  92.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  22.22 
 
 
1612 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  28.49 
 
 
1365 aa  86.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  23.08 
 
 
1426 aa  84.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  24.05 
 
 
1366 aa  83.2  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  22.37 
 
 
1336 aa  82  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  23.34 
 
 
1339 aa  80.9  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  21.2 
 
 
1020 aa  79.7  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  25.43 
 
 
1058 aa  79.7  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  24.82 
 
 
1363 aa  79  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  24.46 
 
 
1339 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  24.46 
 
 
1339 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  22.41 
 
 
1347 aa  77.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  25.69 
 
 
1440 aa  75.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  28.19 
 
 
1432 aa  75.9  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  28.28 
 
 
404 aa  73.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  22.95 
 
 
1241 aa  72.4  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.14 
 
 
950 aa  72  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  32.62 
 
 
836 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  26.05 
 
 
1322 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  24.15 
 
 
1306 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  28.23 
 
 
1343 aa  70.1  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  36.97 
 
 
792 aa  70.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  26.64 
 
 
1338 aa  69.7  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  22.22 
 
 
1712 aa  68.9  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  21.77 
 
 
1290 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  22.2 
 
 
1243 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  23.69 
 
 
1346 aa  66.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  23.1 
 
 
1321 aa  65.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  27.68 
 
 
1459 aa  65.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  21.44 
 
 
1282 aa  65.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  22.95 
 
 
1342 aa  63.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  23.91 
 
 
1441 aa  63.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  23.04 
 
 
1332 aa  63.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  26.76 
 
 
521 aa  62.4  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  23.66 
 
 
1131 aa  62.4  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  22.74 
 
 
1354 aa  62  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  25.19 
 
 
1333 aa  61.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  21.6 
 
 
1461 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.57 
 
 
1452 aa  60.1  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  22.76 
 
 
1349 aa  59.3  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  22.27 
 
 
1022 aa  58.9  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  22.27 
 
 
1375 aa  58.2  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  25.24 
 
 
1355 aa  57.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  22.92 
 
 
1321 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  22.51 
 
 
1219 aa  57  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  25.97 
 
 
416 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  28.23 
 
 
795 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  28.46 
 
 
694 aa  57.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  22.17 
 
 
1322 aa  56.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  44.26 
 
 
816 aa  55.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  23.35 
 
 
1338 aa  56.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  34.59 
 
 
1125 aa  55.8  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  25.2 
 
 
1422 aa  55.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  24.29 
 
 
1278 aa  55.5  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  29.11 
 
 
1373 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  23.58 
 
 
1277 aa  54.7  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  24.73 
 
 
1318 aa  53.5  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  24.8 
 
 
1140 aa  53.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  27.69 
 
 
652 aa  53.5  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  21.04 
 
 
926 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  35.29 
 
 
1425 aa  53.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  26.89 
 
 
908 aa  53.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  24.88 
 
 
1319 aa  53.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  21.85 
 
 
1331 aa  53.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  19.92 
 
 
1098 aa  52.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  28.1 
 
 
518 aa  52.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  21.53 
 
 
1250 aa  52.8  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  24.91 
 
 
309 aa  52  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>