53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0994 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  639    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  55.6 
 
 		 1241 aa  285  7e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  33.1 
 
 		 1144 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1425 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1430 aa  103  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1359 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  33.85 
 
 		 1125 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  29.69 
 
 		 1160 aa  95.9  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1218 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1324 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  32.41 
 
 		 1183 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1171 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1270 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1162 aa  87  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1484 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  31.42 
 
 		 1182 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1497 aa  86.3  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  28.57 
 
 		 1167 aa  85.5  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  28.97 
 
 		 612 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  24.62 
 
 		 1180 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  26.85 
 
 		 1205 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  38.37 
 
 		 1131 aa  68.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  38.37 
 
 		 1140 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  26.19 
 
 		 1219 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  52.63 
 
 		 1174 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1326 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1162 aa  56.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1141 aa  56.2  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1154 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1104 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1154 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1426 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  33.64 
 
 		 914 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  40 
 
 		 929 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  46.03 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  21.11 
 
 		 731 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  33.73 
 
 		 974 aa  47  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  34.83 
 
 		 1058 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1210 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  42.42 
 
 		 1239 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  39.73 
 
 		 871 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1339 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 1041 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  33.33 
 
 		 621 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  26.96 
 
 		 838 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1195 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  31.08 
 
 		 882 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  25.96 
 
 		 1355 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  32.29 
 
 		 1319 aa  43.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1298 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  42.37 
 
 		 684 aa  43.1  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  32.22 
 
 		 909 aa  43.1  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  29.63 
 
 		 836 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>