132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3678 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  39.81 
 
 		 1347 aa  800    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  40.38 
 
 		 1346 aa  816    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  34.91 
 
 		 1342 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  36.18 
 
 		 1321 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  38.05 
 
 		 1440 aa  764    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  35.28 
 
 		 1339 aa  664    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  49.39 
 
 		 1441 aa  1322    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  38.25 
 
 		 1363 aa  787    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  37.91 
 
 		 1365 aa  743    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  35.28 
 
 		 1339 aa  664    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  81.66 
 
 		 846 aa  1402    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  80.67 
 
 		 1452 aa  2370    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  100 
 
 		 1461 aa  2953    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1347 aa  704    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  45.76 
 
 		 1409 aa  1126    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  33.55 
 
 		 1366 aa  602  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  33.47 
 
 		 1353 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  33.93 
 
 		 1290 aa  459  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  32.73 
 
 		 1282 aa  423  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1243 aa  412  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  38.45 
 
 		 536 aa  340  9e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  31.34 
 
 		 512 aa  202  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1581 aa  197  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  31.16 
 
 		 1432 aa  167  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  32.4 
 
 		 1338 aa  161  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1709 aa  152  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1612 aa  136  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  32.29 
 
 		 1422 aa  136  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  32.51 
 
 		 1339 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1426 aa  132  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1151 aa  132  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  29.27 
 
 		 1343 aa  130  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  30.34 
 
 		 1331 aa  129  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  28.57 
 
 		 1338 aa  129  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  30.05 
 
 		 1322 aa  127  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  30.79 
 
 		 1306 aa  128  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  29.64 
 
 		 1712 aa  127  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1098 aa  126  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  29.64 
 
 		 1022 aa  125  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1375 aa  125  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1459 aa  124  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  29.95 
 
 		 1354 aa  122  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  38.27 
 
 		 1319 aa  122  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  28.03 
 
 		 1321 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  25.32 
 
 		 978 aa  120  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  29.77 
 
 		 1358 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  22.68 
 
 		 1277 aa  118  6.9999999999999995e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1572 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  29.2 
 
 		 1336 aa  116  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  25.14 
 
 		 1278 aa  116  3e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  29.06 
 
 		 918 aa  115  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  28.23 
 
 		 925 aa  112  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1188 aa  108  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1332 aa  108  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  25.59 
 
 		 1355 aa  108  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1557 aa  108  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1349 aa  107  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1640 aa  106  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1644 aa  106  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1575 aa  104  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  28.07 
 
 		 1442 aa  103  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1373 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1546 aa  102  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1170 aa  101  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  27.66 
 
 		 1322 aa  100  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  37.06 
 
 		 1219 aa  99.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.09 
 
 		 1573 aa  99.8  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1173 aa  98.6  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  38.55 
 
 		 1318 aa  97.8  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1018 aa  97.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  22.17 
 
 		 1257 aa  97.4  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1751 aa  97.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  32.37 
 
 		 1579 aa  95.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  26.69 
 
 		 869 aa  94.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1250 aa  93.2  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1642 aa  93.2  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  22.22 
 
 		 1244 aa  93.2  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1250 aa  92  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1154 aa  91.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  26.1 
 
 		 1186 aa  90.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  32.8 
 
 		 1640 aa  90.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  29.78 
 
 		 973 aa  89  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1333 aa  88.6  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  22.71 
 
 		 1252 aa  87  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  33.33 
 
 		 1055 aa  84.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1184 aa  80.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  33.16 
 
 		 974 aa  79.3  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  31.02 
 
 		 1581 aa  79  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  22.33 
 
 		 1299 aa  77  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  23.66 
 
 		 1159 aa  77.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  20.79 
 
 		 1186 aa  77  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  32.85 
 
 		 1041 aa  75.5  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  34.13 
 
 		 926 aa  72  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  27.2 
 
 		 882 aa  67.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  23.58 
 
 		 838 aa  65.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1210 aa  66.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  31.69 
 
 		 795 aa  65.9  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  23.1 
 
 		 1256 aa  65.1  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1184 aa  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  19.36 
 
 		 1089 aa  63.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>