84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35210 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  34.77 
 
 
1640 aa  819    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  44.25 
 
 
1575 aa  1106    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  34.2 
 
 
1751 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  61.8 
 
 
1573 aa  1912    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  35.35 
 
 
1579 aa  838    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  47.7 
 
 
1581 aa  1257    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  44.8 
 
 
1572 aa  1111    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  35.32 
 
 
1642 aa  818    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  36.66 
 
 
1557 aa  831    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  36.14 
 
 
1640 aa  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  36.13 
 
 
1644 aa  850    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  100 
 
 
1546 aa  3149    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  26.69 
 
 
1432 aa  143  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  28.6 
 
 
1282 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  26.92 
 
 
1290 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  30.52 
 
 
1338 aa  120  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  25.32 
 
 
1343 aa  119  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  24.03 
 
 
1318 aa  115  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  28.02 
 
 
1712 aa  113  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  28.39 
 
 
1353 aa  111  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  24.81 
 
 
1333 aa  109  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  27.38 
 
 
1336 aa  108  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  28.6 
 
 
1581 aa  107  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  28.06 
 
 
1461 aa  104  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  30.02 
 
 
1339 aa  104  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  25.74 
 
 
1409 aa  104  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  22.99 
 
 
1358 aa  102  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  27.03 
 
 
1354 aa  102  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  26.79 
 
 
846 aa  100  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  27.03 
 
 
1342 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  27.1 
 
 
1098 aa  100  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  27.29 
 
 
1422 aa  97.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  26.46 
 
 
1426 aa  97.8  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  26.64 
 
 
1373 aa  96.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  28.22 
 
 
1322 aa  96.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  29.07 
 
 
1331 aa  95.5  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  31.52 
 
 
1452 aa  95.5  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  25.39 
 
 
1243 aa  94.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  25.04 
 
 
1355 aa  94  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  24.16 
 
 
1612 aa  90.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  25.85 
 
 
1278 aa  90.1  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  26.62 
 
 
1219 aa  90.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  30.74 
 
 
1338 aa  89.4  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  24.85 
 
 
1277 aa  88.6  8e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  26.57 
 
 
1321 aa  87.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  28.1 
 
 
1306 aa  85.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  26.84 
 
 
1321 aa  85.9  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  24.33 
 
 
1346 aa  85.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  25.6 
 
 
1442 aa  84  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  25.05 
 
 
1709 aa  81.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  25.51 
 
 
1365 aa  80.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  30.11 
 
 
1441 aa  80.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  25.75 
 
 
1459 aa  80.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  24.26 
 
 
1332 aa  77.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  25.94 
 
 
1375 aa  77.8  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  25.74 
 
 
1440 aa  75.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  25.94 
 
 
1022 aa  75.1  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  24.06 
 
 
1250 aa  72  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  24.06 
 
 
1250 aa  71.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  24.82 
 
 
1319 aa  70.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  25.17 
 
 
1349 aa  70.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  25.54 
 
 
1055 aa  69.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  28.14 
 
 
974 aa  68.6  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  27.75 
 
 
1298 aa  65.5  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  23.92 
 
 
1322 aa  62.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  23.01 
 
 
1339 aa  61.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  23.01 
 
 
1339 aa  61.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  29.76 
 
 
1347 aa  61.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  26.83 
 
 
995 aa  60.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  29.07 
 
 
1347 aa  60.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.27 
 
 
1041 aa  59.7  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  26.9 
 
 
1366 aa  59.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  29.94 
 
 
926 aa  57.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  29.38 
 
 
1363 aa  56.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  25.15 
 
 
1058 aa  50.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  20.26 
 
 
1089 aa  50.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  30.13 
 
 
1231 aa  49.3  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  25.23 
 
 
1244 aa  48.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  25.23 
 
 
1252 aa  48.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  25.23 
 
 
1257 aa  48.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  25.49 
 
 
1241 aa  47  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  27.72 
 
 
1233 aa  46.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  55.56 
 
 
1104 aa  45.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  24.62 
 
 
1020 aa  45.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>