143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4701 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  100 
 
 
795 aa  1585    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.93 
 
 
995 aa  208  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.43 
 
 
950 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  27.45 
 
 
1036 aa  192  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  29.37 
 
 
1058 aa  179  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.86 
 
 
836 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  24.66 
 
 
1020 aa  143  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  32.25 
 
 
926 aa  134  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  25.3 
 
 
416 aa  88.2  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.32 
 
 
1041 aa  87  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  33.62 
 
 
1339 aa  85.9  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  32.56 
 
 
1422 aa  84.3  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  25.06 
 
 
684 aa  80.9  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  31.13 
 
 
1319 aa  79.7  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  25.32 
 
 
1177 aa  79  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  21.65 
 
 
974 aa  78.2  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  24 
 
 
1125 aa  77  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  32.31 
 
 
1338 aa  76.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  31.69 
 
 
1581 aa  75.1  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  20.51 
 
 
1039 aa  74.7  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  29.41 
 
 
1459 aa  73.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  27.03 
 
 
1170 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  31.71 
 
 
1373 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  30.2 
 
 
1243 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  28.51 
 
 
1333 aa  72  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  22.61 
 
 
1120 aa  72  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  28.36 
 
 
1322 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  19.84 
 
 
1076 aa  71.2  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  29.95 
 
 
1432 aa  70.1  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  28.02 
 
 
1354 aa  70.1  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  19.91 
 
 
1209 aa  69.3  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  30.69 
 
 
1219 aa  67.4  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  28.21 
 
 
1338 aa  67  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  30.92 
 
 
1306 aa  67  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  24.87 
 
 
1426 aa  67.4  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  29.56 
 
 
1343 aa  67.4  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  31.69 
 
 
1461 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  21.37 
 
 
1250 aa  65.5  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  21.37 
 
 
1250 aa  65.5  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  25 
 
 
1178 aa  64.7  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  35.33 
 
 
1055 aa  63.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  28.43 
 
 
1290 aa  62  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  30.69 
 
 
1452 aa  60.8  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  28.96 
 
 
846 aa  60.8  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  29.95 
 
 
1318 aa  60.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  24.52 
 
 
1195 aa  60.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  28.43 
 
 
1282 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.02 
 
 
1002 aa  58.9  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2384  hypothetical protein  28.57 
 
 
732 aa  58.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  25.47 
 
 
1358 aa  58.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  22.97 
 
 
916 aa  58.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  25.61 
 
 
1336 aa  57.8  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  29.53 
 
 
1322 aa  57.8  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  27.01 
 
 
1222 aa  57.4  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  28.23 
 
 
1104 aa  57  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  30.43 
 
 
1441 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  27.46 
 
 
792 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  41.18 
 
 
1425 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  23.45 
 
 
919 aa  57  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  26.26 
 
 
1278 aa  56.2  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  26.97 
 
 
1346 aa  55.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  29.08 
 
 
1612 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  28.82 
 
 
1342 aa  55.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  26.67 
 
 
1363 aa  54.7  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  21.05 
 
 
1132 aa  53.5  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  22.03 
 
 
1257 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  22.03 
 
 
1252 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  25 
 
 
746 aa  53.9  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  25 
 
 
1557 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  26.26 
 
 
1277 aa  53.9  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  33.04 
 
 
1324 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  35.79 
 
 
1359 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  26.57 
 
 
1231 aa  52.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  31.34 
 
 
1239 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  31.28 
 
 
1353 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  25.53 
 
 
1712 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  22.03 
 
 
1244 aa  52.8  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  27.17 
 
 
1189 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  26.26 
 
 
1347 aa  52.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  23.7 
 
 
1209 aa  52.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  25.68 
 
 
1339 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  25.68 
 
 
1339 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  22.53 
 
 
1183 aa  52  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  25.62 
 
 
1642 aa  52  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  28.48 
 
 
1355 aa  52  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.77 
 
 
1640 aa  51.6  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  28.64 
 
 
1409 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  27.98 
 
 
1321 aa  51.6  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  29.03 
 
 
1709 aa  51.2  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  26.67 
 
 
1644 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  27.62 
 
 
1440 aa  51.2  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  24.31 
 
 
1579 aa  51.2  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  24.76 
 
 
1640 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2728  putative DNA methylase  23.58 
 
 
1208 aa  50.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  27.81 
 
 
1088 aa  50.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  28.14 
 
 
1233 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  26.04 
 
 
775 aa  50.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  26.28 
 
 
1256 aa  49.7  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  29.94 
 
 
1321 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  21.71 
 
 
1089 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>