136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1179 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1321 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  37.2 
 
 		 1440 aa  746    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  35.33 
 
 		 1339 aa  665    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  39.22 
 
 		 1346 aa  791    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  34.93 
 
 		 1347 aa  680    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  49.46 
 
 		 1441 aa  1297    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  37.19 
 
 		 1365 aa  729    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  35.33 
 
 		 1339 aa  665    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  36.07 
 
 		 1363 aa  748    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  83.16 
 
 		 846 aa  1421    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  100 
 
 		 1452 aa  2948    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  80.67 
 
 		 1461 aa  2370    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  46.78 
 
 		 1409 aa  1155    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  40.43 
 
 		 1347 aa  818    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  35.32 
 
 		 1342 aa  628  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1366 aa  616  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  33.44 
 
 		 1353 aa  563  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  32.45 
 
 		 1290 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1282 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1243 aa  392  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  35.97 
 
 		 536 aa  309  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  33.47 
 
 		 512 aa  228  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1581 aa  187  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1709 aa  160  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  30.14 
 
 		 1432 aa  150  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  32.19 
 
 		 1338 aa  145  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1612 aa  134  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  27.11 
 
 		 978 aa  133  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  30.22 
 
 		 1322 aa  131  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1422 aa  129  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1375 aa  125  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1022 aa  124  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  30.81 
 
 		 1306 aa  124  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  28.34 
 
 		 1343 aa  124  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  27.64 
 
 		 1712 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  24.87 
 
 		 1277 aa  122  4.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  37.24 
 
 		 1319 aa  122  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  29.44 
 
 		 1331 aa  122  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1459 aa  120  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  28.63 
 
 		 918 aa  120  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  29.19 
 
 		 1321 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  31.32 
 
 		 1426 aa  116  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1098 aa  116  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  28.76 
 
 		 925 aa  115  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1572 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  40.54 
 
 		 1339 aa  114  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  36.65 
 
 		 1354 aa  113  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  23.14 
 
 		 1278 aa  112  6e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  28.72 
 
 		 1358 aa  112  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1151 aa  110  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  35.84 
 
 		 1338 aa  110  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  27.42 
 
 		 1336 aa  107  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  25.92 
 
 		 1355 aa  107  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  28.89 
 
 		 1442 aa  106  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1557 aa  105  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  30.91 
 
 		 1219 aa  105  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1640 aa  105  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1332 aa  105  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1642 aa  105  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  29.33 
 
 		 1318 aa  104  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1349 aa  104  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1644 aa  104  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1575 aa  102  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1373 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.52 
 
 		 1640 aa  98.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  22.17 
 
 		 1257 aa  97.1  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1018 aa  96.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  27.86 
 
 		 1322 aa  95.5  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1751 aa  95.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  31.52 
 
 		 1546 aa  95.5  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1170 aa  94  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  22.67 
 
 		 1244 aa  93.2  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1579 aa  92.4  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1173 aa  92.8  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  22.07 
 
 		 1250 aa  91.3  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  22.07 
 
 		 1250 aa  91.3  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1333 aa  89  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1154 aa  88.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.6 
 
 		 1573 aa  88.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  22.64 
 
 		 1159 aa  87  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  22.71 
 
 		 1252 aa  86.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1188 aa  82.4  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  32.18 
 
 		 1055 aa  81.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  25.77 
 
 		 1186 aa  79  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  27.13 
 
 		 1581 aa  78.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1154 aa  77.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  25.04 
 
 		 869 aa  76.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  31.55 
 
 		 974 aa  77  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  25.83 
 
 		 973 aa  75.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  19.66 
 
 		 1186 aa  75.1  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  33.58 
 
 		 1041 aa  71.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  29.94 
 
 		 926 aa  71.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  21.61 
 
 		 1256 aa  69.7  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  24.79 
 
 		 430 aa  67.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1210 aa  67  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  26.78 
 
 		 882 aa  66.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  34.62 
 
 		 1170 aa  65.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1184 aa  64.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  21.9 
 
 		 1132 aa  63.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.14 
 
 		 1298 aa  63.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>