More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1501 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  100 
 
 		 974 aa  1983    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  29.9 
 
 		 995 aa  392  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  38.57 
 
 		 1041 aa  370  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1036 aa  299  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1426 aa  233  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  32.27 
 
 		 1147 aa  230  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  26.88 
 
 		 1058 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1154 aa  212  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1299 aa  212  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1120 aa  196  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1209 aa  194  9e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  30.11 
 
 		 1244 aa  190  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  28.84 
 
 		 1338 aa  183  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  30.59 
 
 		 1159 aa  184  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1177 aa  178  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  27.27 
 
 		 1257 aa  174  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  24.01 
 
 		 1020 aa  172  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  29.68 
 
 		 1076 aa  167  6.9999999999999995e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.54 
 
 		 836 aa  157  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  24.73 
 
 		 950 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  25.67 
 
 		 1132 aa  140  8.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  29.5 
 
 		 410 aa  131  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1338 aa  128  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  22.5 
 
 		 652 aa  116  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  30.03 
 
 		 1432 aa  110  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1612 aa  109  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  27.47 
 
 		 1343 aa  105  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1104 aa  105  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  22.36 
 
 		 518 aa  104  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  24.85 
 
 		 557 aa  103  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  24.62 
 
 		 621 aa  102  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  20.39 
 
 		 629 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  25.57 
 
 		 562 aa  99.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  28.9 
 
 		 493 aa  99.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  29.57 
 
 		 416 aa  99.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  24.79 
 
 		 1354 aa  96.3  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  25.07 
 
 		 1319 aa  93.6  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  24.56 
 
 		 1170 aa  94  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  28.85 
 
 		 792 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  26.36 
 
 		 1055 aa  91.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1298 aa  90.9  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1339 aa  90.1  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1184 aa  89.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  24.32 
 
 		 1336 aa  89.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  25.75 
 
 		 1256 aa  89.4  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1243 aa  87.8  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  24.6 
 
 		 1252 aa  87.8  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  25.53 
 
 		 1318 aa  87  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  29.96 
 
 		 504 aa  86.3  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1459 aa  87  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  26.74 
 
 		 1322 aa  87  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  23.13 
 
 		 1186 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  26.45 
 
 		 694 aa  84.7  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1332 aa  83.2  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  20.83 
 
 		 978 aa  82.4  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  30.53 
 
 		 1089 aa  82  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1018 aa  82  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  25.13 
 
 		 918 aa  82  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1422 aa  81.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  24.51 
 
 		 1186 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  24.54 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  33.16 
 
 		 1461 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  21.65 
 
 		 795 aa  78.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  34.04 
 
 		 1441 aa  78.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  33.69 
 
 		 846 aa  78.2  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  31.1 
 
 		 816 aa  77.8  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1173 aa  77.4  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1039 aa  77.4  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1154 aa  77.4  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1452 aa  77  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  25.09 
 
 		 1306 aa  76.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1557 aa  75.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  25 
 
 		 1278 aa  75.9  0.000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  25 
 
 		 1277 aa  75.1  0.000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  25.2 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  31.5 
 
 		 1346 aa  75.1  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  21.75 
 
 		 1322 aa  74.7  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1581 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1178 aa  74.3  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  26.73 
 
 		 247 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  38.05 
 
 		 478 aa  73.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  31.14 
 
 		 1640 aa  73.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  21.18 
 
 		 1282 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  29.85 
 
 		 1338 aa  72.8  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  37.61 
 
 		 1184 aa  72.4  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  20.9 
 
 		 1239 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1644 aa  72.4  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1642 aa  72.4  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1359 aa  72  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1349 aa  72  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  30 
 
 		 1640 aa  72  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  20.7 
 
 		 684 aa  71.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1365 aa  71.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  27.3 
 
 		 925 aa  71.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.59 
 
 		 1573 aa  71.2  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  25.87 
 
 		 934 aa  70.5  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  31.15 
 
 		 1144 aa  70.5  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  27.71 
 
 		 1712 aa  70.1  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1366 aa  70.1  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  24.31 
 
 		 1331 aa  70.1  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>