95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1417 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  45.59 
 
 
1642 aa  1358    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  35.74 
 
 
1751 aa  728    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  54.17 
 
 
1579 aa  1653    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  34.3 
 
 
1573 aa  806    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  100 
 
 
1557 aa  3232    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  34.21 
 
 
1575 aa  703    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  35.01 
 
 
1546 aa  835    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  45.94 
 
 
1644 aa  1378    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  46.18 
 
 
1640 aa  1388    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  35.6 
 
 
1581 aa  792    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  44.14 
 
 
1640 aa  1327    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  34.05 
 
 
1572 aa  719    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  25.5 
 
 
1343 aa  240  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  23.48 
 
 
1318 aa  172  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  23.69 
 
 
1354 aa  153  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  26.21 
 
 
1432 aa  152  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  26.74 
 
 
1581 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  25.15 
 
 
1282 aa  121  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  25.35 
 
 
1290 aa  118  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  27.63 
 
 
1338 aa  118  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  25.68 
 
 
1321 aa  118  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  24.53 
 
 
1338 aa  116  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  26.78 
 
 
1342 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  24.79 
 
 
1441 aa  114  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  26.69 
 
 
1336 aa  112  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  25.46 
 
 
1353 aa  111  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  25.37 
 
 
1250 aa  111  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  26.24 
 
 
1319 aa  111  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  25.37 
 
 
1250 aa  110  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  24.86 
 
 
1373 aa  110  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  25.73 
 
 
1426 aa  110  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  26.05 
 
 
1461 aa  109  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  27.79 
 
 
1712 aa  107  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  24.76 
 
 
1459 aa  106  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  26.13 
 
 
1358 aa  106  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  26 
 
 
1452 aa  105  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  25.21 
 
 
1219 aa  105  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  24.32 
 
 
1333 aa  103  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  25.63 
 
 
1346 aa  103  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  26.14 
 
 
846 aa  102  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  24.22 
 
 
1612 aa  102  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  25.34 
 
 
1055 aa  101  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  24.51 
 
 
1322 aa  100  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  24.37 
 
 
1355 aa  100  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  25.28 
 
 
1339 aa  98.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  31.7 
 
 
1409 aa  97.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  25.48 
 
 
1422 aa  91.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  24.72 
 
 
1709 aa  90.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  25.57 
 
 
1321 aa  90.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  27.57 
 
 
1331 aa  89.4  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  25.56 
 
 
1306 aa  87.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  26.61 
 
 
1277 aa  85.5  0.000000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  26.61 
 
 
1278 aa  84.7  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  25.3 
 
 
1363 aa  83.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  23.91 
 
 
1339 aa  83.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  23.91 
 
 
1339 aa  83.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  28.32 
 
 
1442 aa  80.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  23.66 
 
 
1098 aa  79.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  22.33 
 
 
1375 aa  78.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  33.89 
 
 
1243 aa  78.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  22.33 
 
 
1022 aa  77.8  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  30.18 
 
 
974 aa  75.9  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  23.34 
 
 
1332 aa  75.5  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  25.79 
 
 
1366 aa  75.1  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  23.36 
 
 
1322 aa  75.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  36.8 
 
 
1041 aa  73.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  29.89 
 
 
1347 aa  69.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  31.21 
 
 
926 aa  68.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  22.92 
 
 
1349 aa  68.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  32.93 
 
 
1347 aa  66.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  29.8 
 
 
1365 aa  63.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  26.58 
 
 
950 aa  62.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.04 
 
 
995 aa  62.8  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  27.95 
 
 
1440 aa  60.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  23.38 
 
 
1257 aa  57.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  23.38 
 
 
1244 aa  57.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  22.89 
 
 
1252 aa  56.6  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  23.27 
 
 
1058 aa  56.6  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  24.15 
 
 
1186 aa  56.2  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  21.18 
 
 
1298 aa  55.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  24.12 
 
 
1020 aa  55.5  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  25 
 
 
795 aa  55.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  30.13 
 
 
1184 aa  55.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  33.33 
 
 
882 aa  53.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.32 
 
 
836 aa  52.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  25.52 
 
 
1036 aa  52.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  20.69 
 
 
1256 aa  49.3  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  29.46 
 
 
1038 aa  48.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  29.31 
 
 
1425 aa  47.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  30.17 
 
 
1147 aa  46.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  24.34 
 
 
1177 aa  46.6  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  21.47 
 
 
1089 aa  47  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  50 
 
 
1104 aa  46.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  24.22 
 
 
1170 aa  45.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  36.25 
 
 
792 aa  45.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>