161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2540 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  100 
 
 		 1612 aa  3327    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  30.47 
 
 		 1432 aa  478  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  38.51 
 
 		 1426 aa  410  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  30.58 
 
 		 1442 aa  258  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1098 aa  253  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1332 aa  240  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1349 aa  239  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1375 aa  237  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1022 aa  236  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1250 aa  206  3e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  24 
 
 		 1250 aa  203  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1154 aa  199  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  26.57 
 
 		 1336 aa  196  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  24.84 
 
 		 1343 aa  179  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  29.89 
 
 		 995 aa  176  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1036 aa  176  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1338 aa  171  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1581 aa  166  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  27.96 
 
 		 1219 aa  165  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1339 aa  165  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  23.46 
 
 		 1277 aa  164  1e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  22.32 
 
 		 1278 aa  162  5e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1353 aa  159  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1459 aa  159  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  24.07 
 
 		 1712 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1422 aa  156  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  25.3 
 
 		 1354 aa  154  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  25.63 
 
 		 1318 aa  150  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  25.13 
 
 		 1306 aa  148  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1282 aa  144  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  26.33 
 
 		 1331 aa  141  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1290 aa  141  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1342 aa  139  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1333 aa  138  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1373 aa  138  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  24.04 
 
 		 629 aa  137  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1461 aa  136  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1177 aa  136  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  23.2 
 
 		 1257 aa  135  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1452 aa  134  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1366 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  24.31 
 
 		 1338 aa  134  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  27.38 
 
 		 1159 aa  134  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1347 aa  132  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1441 aa  132  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1572 aa  131  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1709 aa  130  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1321 aa  130  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  23.14 
 
 		 1321 aa  129  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  29.48 
 
 		 1076 aa  128  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  23.06 
 
 		 1244 aa  127  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1147 aa  125  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1243 aa  125  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  24.7 
 
 		 1322 aa  125  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  23.37 
 
 		 1252 aa  123  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  27.4 
 
 		 410 aa  122  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  24.9 
 
 		 1186 aa  122  7.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  27.09 
 
 		 1319 aa  121  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  25.67 
 
 		 1358 aa  121  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1339 aa  120  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1339 aa  120  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1338 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  24.56 
 
 		 1055 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  22.62 
 
 		 1256 aa  117  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1346 aa  115  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1440 aa  115  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1347 aa  114  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1409 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1575 aa  112  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  30.61 
 
 		 1322 aa  112  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  24.23 
 
 		 562 aa  111  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  24.03 
 
 		 1041 aa  110  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1120 aa  110  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  30.45 
 
 		 974 aa  109  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.13 
 
 		 836 aa  109  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1363 aa  107  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  25.09 
 
 		 1355 aa  107  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  27.85 
 
 		 846 aa  105  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  23.43 
 
 		 557 aa  103  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  25.49 
 
 		 1132 aa  102  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1557 aa  101  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1644 aa  100  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  22.32 
 
 		 518 aa  99.8  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1640 aa  99  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1642 aa  98.6  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  25.49 
 
 		 1581 aa  98.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.59 
 
 		 1640 aa  97.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1209 aa  97.1  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  25.43 
 
 		 570 aa  96.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1751 aa  91.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1365 aa  90.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1104 aa  89.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  26.74 
 
 		 493 aa  87.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  22.22 
 
 		 1089 aa  86.7  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1299 aa  86.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  22.6 
 
 		 950 aa  85.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.25 
 
 		 1573 aa  85.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1546 aa  84  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  34.9 
 
 		 416 aa  81.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  25.39 
 
 		 1058 aa  82  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>