89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6769 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  46.25 
 
 		 1332 aa  1090    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  37.76 
 
 		 1098 aa  673    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  41.89 
 
 		 1022 aa  759    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  41.34 
 
 		 1375 aa  960    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  100 
 
 		 1349 aa  2707    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1612 aa  249  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1250 aa  246  3e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1250 aa  244  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1426 aa  227  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  29.72 
 
 		 1432 aa  221  8.999999999999998e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  28.14 
 
 		 1712 aa  202  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  24.81 
 
 		 1319 aa  191  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  25.05 
 
 		 1354 aa  179  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  25.43 
 
 		 1338 aa  177  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  24.56 
 
 		 1306 aa  176  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  26.7 
 
 		 1336 aa  174  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1338 aa  174  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  25.06 
 
 		 1358 aa  173  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  23.06 
 
 		 1277 aa  172  4e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1339 aa  171  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1459 aa  170  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  25.12 
 
 		 1442 aa  169  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  23.39 
 
 		 1278 aa  169  2.9999999999999998e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  24.4 
 
 		 1355 aa  169  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  25 
 
 		 1422 aa  163  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  24.18 
 
 		 1322 aa  158  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  28.92 
 
 		 1343 aa  154  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1581 aa  153  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  27.98 
 
 		 1219 aa  153  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1298 aa  152  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  24.56 
 
 		 1322 aa  148  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  26.74 
 
 		 1321 aa  147  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  24.18 
 
 		 1331 aa  146  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  26.96 
 
 		 1055 aa  141  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  26.31 
 
 		 1282 aa  140  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1290 aa  138  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  27.7 
 
 		 1318 aa  124  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1333 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1321 aa  123  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1342 aa  121  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1373 aa  118  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  31.35 
 
 		 1346 aa  116  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1461 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1709 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  26 
 
 		 1363 aa  110  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1452 aa  110  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1353 aa  108  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1347 aa  107  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1441 aa  105  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1243 aa  101  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1409 aa  99.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1440 aa  97.8  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1365 aa  87.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  32.26 
 
 		 846 aa  87  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1366 aa  83.2  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1347 aa  82  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1572 aa  82  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1339 aa  82  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1339 aa  82  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  22.12 
 
 		 1041 aa  76.6  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  24 
 
 		 1575 aa  73.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  21.91 
 
 		 974 aa  72  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1546 aa  69.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.62 
 
 		 1573 aa  62.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1644 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.52 
 
 		 1640 aa  60.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  22.33 
 
 		 1642 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.22 
 
 		 1020 aa  59.7  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1557 aa  60.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1751 aa  60.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  22.28 
 
 		 1640 aa  58.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1579 aa  58.5  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  19.5 
 
 		 1252 aa  58.2  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1104 aa  57.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  20 
 
 		 1257 aa  56.2  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  23.87 
 
 		 1581 aa  55.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  20.32 
 
 		 1244 aa  54.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1359 aa  53.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1299 aa  51.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  19.5 
 
 		 1058 aa  51.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  22.74 
 
 		 882 aa  50.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  25.32 
 
 		 926 aa  50.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  21.04 
 
 		 1170 aa  50.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1154 aa  49.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  20.3 
 
 		 1177 aa  48.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1088 aa  48.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  20.59 
 
 		 1186 aa  45.8  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  47.62 
 
 		 512 aa  45.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.07 
 
 		 950 aa  45.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>