140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1272 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  40.22 
 
 		 1342 aa  838    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  39.05 
 
 		 1321 aa  818    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  100 
 
 		 1353 aa  2805    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  33.44 
 
 		 1452 aa  563  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  33.49 
 
 		 1409 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1346 aa  552  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  33.47 
 
 		 1461 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  32 
 
 		 1440 aa  510  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  31.41 
 
 		 1363 aa  512  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1441 aa  487  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  31.5 
 
 		 1365 aa  483  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1347 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1339 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1339 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1366 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  34.58 
 
 		 1347 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1243 aa  369  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1290 aa  335  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1282 aa  325  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  35.15 
 
 		 846 aa  300  9e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  34.69 
 
 		 536 aa  239  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  26.68 
 
 		 1581 aa  203  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  25.38 
 
 		 1432 aa  175  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1151 aa  161  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1612 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1173 aa  159  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  28.16 
 
 		 978 aa  158  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  28.09 
 
 		 512 aa  146  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1184 aa  135  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  28.42 
 
 		 918 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1709 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1250 aa  132  6e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1338 aa  131  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1375 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1022 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  22.28 
 
 		 1250 aa  129  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1170 aa  127  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1188 aa  126  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  25.68 
 
 		 1712 aa  125  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  28.75 
 
 		 1343 aa  123  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  26.79 
 
 		 925 aa  122  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1422 aa  121  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  28.26 
 
 		 1186 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  29.91 
 
 		 1306 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1572 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  29.97 
 
 		 430 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1575 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1426 aa  115  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.37 
 
 		 1573 aa  113  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  27.06 
 
 		 1354 aa  113  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  28.65 
 
 		 1321 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  27.18 
 
 		 1331 aa  111  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  27.94 
 
 		 1336 aa  111  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  25.92 
 
 		 869 aa  110  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1154 aa  109  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1557 aa  109  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  38.95 
 
 		 1339 aa  108  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1546 aa  108  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  28.02 
 
 		 1358 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  26.03 
 
 		 1338 aa  106  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  33.8 
 
 		 1459 aa  105  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  25.1 
 
 		 1581 aa  104  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1018 aa  103  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  34.48 
 
 		 1322 aa  103  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1098 aa  102  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1349 aa  102  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  37.34 
 
 		 1373 aa  102  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1333 aa  101  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  39.47 
 
 		 1319 aa  100  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1579 aa  100  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  28.42 
 
 		 1219 aa  99  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1751 aa  98.6  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1644 aa  95.9  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1642 aa  95.1  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1640 aa  94.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.52 
 
 		 1640 aa  94  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  22.25 
 
 		 1277 aa  94.4  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  34.19 
 
 		 1355 aa  90.9  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  33.98 
 
 		 1442 aa  89.4  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  21.53 
 
 		 1278 aa  88.6  8e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  22.09 
 
 		 908 aa  87.8  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  35.14 
 
 		 1318 aa  87  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1332 aa  83.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  27.45 
 
 		 1055 aa  82  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  23.94 
 
 		 909 aa  79.7  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  31.78 
 
 		 1322 aa  78.2  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  22.9 
 
 		 914 aa  73.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  21.64 
 
 		 1252 aa  72.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  23.01 
 
 		 871 aa  70.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  32.93 
 
 		 926 aa  69.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  20.81 
 
 		 912 aa  69.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  20.85 
 
 		 1159 aa  69.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  24.11 
 
 		 973 aa  68.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  23.22 
 
 		 934 aa  68.6  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  23.61 
 
 		 932 aa  67.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1184 aa  67.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  26.6 
 
 		 1058 aa  67  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  34.43 
 
 		 1041 aa  66.2  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  21.79 
 
 		 1244 aa  65.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  21.88 
 
 		 1257 aa  65.5  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>