74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0759 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  45.85 
 
 		 871 aa  767    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  37.99 
 
 		 928 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  43.24 
 
 		 916 aa  767    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  46.91 
 
 		 914 aa  825    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  100 
 
 		 912 aa  1887    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  38.17 
 
 		 926 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  38.47 
 
 		 932 aa  642    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  36.84 
 
 		 928 aa  630  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  37.24 
 
 		 926 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  37.42 
 
 		 921 aa  625  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  36.79 
 
 		 918 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  36.83 
 
 		 929 aa  588  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  39.58 
 
 		 908 aa  586  1e-166  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  35.24 
 
 		 909 aa  585  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  37.47 
 
 		 933 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  36.15 
 
 		 928 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  35.12 
 
 		 937 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  37.65 
 
 		 909 aa  549  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  34.73 
 
 		 934 aa  501  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  36.22 
 
 		 919 aa  495  9.999999999999999e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  30.48 
 
 		 941 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  33.72 
 
 		 934 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  33.55 
 
 		 929 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  31.13 
 
 		 955 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  33.93 
 
 		 622 aa  340  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  25.36 
 
 		 925 aa  172  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  23.22 
 
 		 978 aa  164  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1173 aa  163  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1151 aa  163  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  23.45 
 
 		 918 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1184 aa  150  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1154 aa  144  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1188 aa  144  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  25.57 
 
 		 621 aa  142  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  22.33 
 
 		 1186 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  20.82 
 
 		 1170 aa  129  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  25.89 
 
 		 973 aa  129  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1018 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  21.96 
 
 		 869 aa  99.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1321 aa  89  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1342 aa  70.1  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  20.81 
 
 		 1353 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  34.44 
 
 		 97 aa  64.3  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  22.04 
 
 		 430 aa  63.9  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  21.27 
 
 		 1243 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  22.51 
 
 		 694 aa  61.6  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0351  hypothetical protein  44.62 
 
 		 75 aa  60.1  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000592676  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1298 aa  57.8  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.44 
 
 		 974 aa  57.4  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  19.91 
 
 		 1346 aa  56.6  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1282 aa  56.6  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1210 aa  55.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  32.58 
 
 		 1041 aa  54.7  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  21 
 
 		 1461 aa  54.7  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1290 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  24.12 
 
 		 1058 aa  53.9  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  19.35 
 
 		 1347 aa  53.9  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  21.09 
 
 		 1409 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  38.75 
 
 		 1002 aa  53.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  26.52 
 
 		 995 aa  50.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  26.27 
 
 		 1076 aa  49.3  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  20.24 
 
 		 1366 aa  48.9  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  19.39 
 
 		 1339 aa  48.9  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  21.86 
 
 		 504 aa  48.5  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1120 aa  48.1  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  33.8 
 
 		 1322 aa  47.8  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  27 
 
 		 1359 aa  47.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1425 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1125 aa  47.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  38.37 
 
 		 1177 aa  45.8  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  25.41 
 
 		 1055 aa  45.8  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  24.12 
 
 		 792 aa  45.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  25 
 
 		 416 aa  45.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  24.59 
 
 		 1219 aa  45.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>