25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1615 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  202  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  49.43 
 
 		 928 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  47.62 
 
 		 937 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  50.59 
 
 		 914 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  49.43 
 
 		 909 aa  82.4  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  51.14 
 
 		 908 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  47.67 
 
 		 919 aa  79  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  41.38 
 
 		 933 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  37.21 
 
 		 909 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  37.78 
 
 		 916 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  37.08 
 
 		 929 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  34.48 
 
 		 928 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  33.71 
 
 		 928 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  35.63 
 
 		 926 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  35.29 
 
 		 622 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  34.44 
 
 		 912 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  35.37 
 
 		 932 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  34.09 
 
 		 926 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  39.77 
 
 		 941 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  34.48 
 
 		 921 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  37.21 
 
 		 871 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  33.33 
 
 		 918 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  34.83 
 
 		 929 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  37 
 
 		 934 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  32.26 
 
 		 934 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>