59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0261 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  58.71 
 
 
918 aa  1073    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  50.55 
 
 
929 aa  874    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  59.43 
 
 
932 aa  1082    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  61.84 
 
 
926 aa  1129    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  60.5 
 
 
928 aa  1115    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  59.89 
 
 
928 aa  1102    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  59.83 
 
 
926 aa  1093    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  100 
 
 
909 aa  1888    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  62.34 
 
 
921 aa  1161    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  36.72 
 
 
914 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  35.24 
 
 
912 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  34.89 
 
 
871 aa  510  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  33.3 
 
 
916 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  46.99 
 
 
622 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  32.11 
 
 
933 aa  457  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  32.61 
 
 
908 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  31.62 
 
 
909 aa  437  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  33.03 
 
 
929 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  31.7 
 
 
937 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  30.84 
 
 
934 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  29.89 
 
 
928 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  29.92 
 
 
919 aa  369  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  30.69 
 
 
941 aa  362  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  28.52 
 
 
934 aa  351  3e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  30.34 
 
 
955 aa  335  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  22.74 
 
 
1151 aa  131  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  26.61 
 
 
621 aa  119  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  28.95 
 
 
978 aa  118  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  29.1 
 
 
925 aa  111  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  27.45 
 
 
973 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  23.51 
 
 
1154 aa  108  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  25.34 
 
 
918 aa  104  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0349  hypothetical protein  58.95 
 
 
115 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270538  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  27.65 
 
 
1173 aa  99.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  24.65 
 
 
1184 aa  97.8  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  25.73 
 
 
1188 aa  94.4  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  24.27 
 
 
1186 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  24.16 
 
 
1170 aa  88.2  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  23.55 
 
 
1018 aa  86.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  34.23 
 
 
869 aa  73.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  37.21 
 
 
97 aa  69.7  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  24.06 
 
 
1441 aa  70.1  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  24.13 
 
 
1342 aa  64.7  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  23.18 
 
 
1366 aa  63.9  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  21.53 
 
 
694 aa  60.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  23.51 
 
 
1282 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  22.67 
 
 
1440 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  21.38 
 
 
1347 aa  55.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  22.62 
 
 
1321 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  28.99 
 
 
1041 aa  49.7  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  22.28 
 
 
504 aa  49.7  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  29.73 
 
 
995 aa  48.9  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  21.05 
 
 
1363 aa  48.9  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  25 
 
 
1298 aa  48.5  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  22.37 
 
 
512 aa  48.5  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  23.72 
 
 
1339 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  26.19 
 
 
1239 aa  47  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  21.46 
 
 
1299 aa  45.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  20.71 
 
 
1347 aa  45.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>