94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1465 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  49.84 
 
 		 916 aa  910    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  100 
 
 		 914 aa  1897    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  46.99 
 
 		 912 aa  833    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  38.82 
 
 		 933 aa  645    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  40.68 
 
 		 908 aa  647    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  56.88 
 
 		 871 aa  1031    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  38.3 
 
 		 928 aa  633  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  38.07 
 
 		 926 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  38.33 
 
 		 928 aa  624  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  37.67 
 
 		 926 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  37.64 
 
 		 932 aa  616  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  36.98 
 
 		 929 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  38.07 
 
 		 909 aa  601  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  38.5 
 
 		 937 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  36.43 
 
 		 909 aa  584  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  37 
 
 		 928 aa  580  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  37.47 
 
 		 918 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  35.24 
 
 		 921 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  39.28 
 
 		 919 aa  553  1e-156  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  33.3 
 
 		 934 aa  509  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  36.51 
 
 		 929 aa  482  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  35.16 
 
 		 934 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  33.71 
 
 		 955 aa  439  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  31.76 
 
 		 941 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  34.22 
 
 		 622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1151 aa  175  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  26.09 
 
 		 925 aa  170  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  30.5 
 
 		 978 aa  155  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  29.72 
 
 		 918 aa  151  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  23.66 
 
 		 1186 aa  141  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1184 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  29.17 
 
 		 621 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  25.29 
 
 		 973 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1018 aa  125  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1170 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1173 aa  119  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1188 aa  115  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1154 aa  113  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  22.25 
 
 		 869 aa  109  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  87  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1353 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1298 aa  69.3  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1282 aa  68.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1290 aa  61.6  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  26.22 
 
 		 974 aa  60.1  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  21.46 
 
 		 1347 aa  58.9  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  24.35 
 
 		 504 aa  56.6  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1321 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1339 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1339 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  20.84 
 
 		 1346 aa  55.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1342 aa  55.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1373 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  34.85 
 
 		 1366 aa  55.1  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1338 aa  55.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25.79 
 
 		 950 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  27.03 
 
 		 1041 aa  52.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1422 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  23.27 
 
 		 694 aa  52.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1333 aa  52  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  23.49 
 
 		 1058 aa  51.6  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  21.11 
 
 		 1347 aa  52  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  22.6 
 
 		 1432 aa  51.6  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1339 aa  51.2  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1243 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1210 aa  51.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  21.54 
 
 		 530 aa  49.7  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.77 
 
 		 1076 aa  50.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1365 aa  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1195 aa  49.7  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  31.45 
 
 		 1002 aa  49.7  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  34.65 
 
 		 792 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.53 
 
 		 995 aa  49.3  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  26.81 
 
 		 1358 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  33.64 
 
 		 309 aa  48.9  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  32.67 
 
 		 1440 aa  48.5  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  24.55 
 
 		 1189 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  28.26 
 
 		 1712 aa  46.6  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  23.5 
 
 		 502 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  28.24 
 
 		 1338 aa  46.2  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1022 aa  45.8  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  20.72 
 
 		 654 aa  45.8  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1241 aa  45.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0349  hypothetical protein  32.65 
 
 		 115 aa  45.4  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270538  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  28.8 
 
 		 836 aa  45.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  30.33 
 
 		 1322 aa  45.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  24.54 
 
 		 405 aa  45.1  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1218 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1363 aa  44.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  20.62 
 
 		 1319 aa  44.7  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1104 aa  44.7  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  26.72 
 
 		 1219 aa  44.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  36 
 
 		 1125 aa  44.3  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  29.71 
 
 		 1306 aa  44.3  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>