58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4502 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  100 
 
 		 955 aa  1971    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  45.73 
 
 		 934 aa  761    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  45.63 
 
 		 929 aa  766    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  36.35 
 
 		 908 aa  523  1e-147  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  36.18 
 
 		 909 aa  503  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  35.67 
 
 		 934 aa  496  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  36.9 
 
 		 933 aa  482  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  37.8 
 
 		 928 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  37.58 
 
 		 937 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  34.86 
 
 		 871 aa  462  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  36.33 
 
 		 941 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  33.63 
 
 		 919 aa  435  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  33.71 
 
 		 914 aa  436  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  32.87 
 
 		 916 aa  428  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  31.13 
 
 		 912 aa  412  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  33.04 
 
 		 926 aa  396  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  32.59 
 
 		 928 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  32.85 
 
 		 932 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  32.55 
 
 		 926 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  32.53 
 
 		 928 aa  388  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  30.48 
 
 		 921 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  31.18 
 
 		 918 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  30.34 
 
 		 909 aa  335  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  28.55 
 
 		 929 aa  300  9e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  27.12 
 
 		 622 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  27.16 
 
 		 978 aa  184  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  25.43 
 
 		 925 aa  167  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1184 aa  156  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1173 aa  156  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1151 aa  152  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  24.91 
 
 		 918 aa  149  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1154 aa  128  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  23.07 
 
 		 1170 aa  122  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1188 aa  122  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1018 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  23.97 
 
 		 973 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  24.69 
 
 		 1186 aa  109  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  21.91 
 
 		 621 aa  97.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  22.95 
 
 		 869 aa  90.1  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  24.65 
 
 		 838 aa  74.7  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1290 aa  64.3  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1243 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1282 aa  58.5  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1461 aa  57  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1088 aa  56.2  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1366 aa  54.7  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  21.27 
 
 		 1353 aa  53.5  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  23.11 
 
 		 536 aa  53.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  20.29 
 
 		 1154 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1342 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  22.05 
 
 		 512 aa  48.9  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  20.36 
 
 		 1058 aa  48.5  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1452 aa  47.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1339 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1347 aa  45.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1298 aa  44.7  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  25.23 
 
 		 504 aa  44.7  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  19.25 
 
 		 1020 aa  44.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>