99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3203 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  49.75 
 
 		 1209 aa  1060    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  100 
 
 		 1189 aa  2406    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  44.79 
 
 		 1233 aa  937    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  47.53 
 
 		 1222 aa  1006    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2728  putative DNA methylase  40.59 
 
 		 1208 aa  789    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  49.71 
 
 		 1195 aa  1048    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  42.51 
 
 		 1231 aa  892    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  47.9 
 
 		 1239 aa  1001    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  35.01 
 
 		 1282 aa  543  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  21.38 
 
 		 995 aa  92  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25.83 
 
 		 950 aa  86.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1036 aa  79.3  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  33.82 
 
 		 1038 aa  77.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  26.12 
 
 		 416 aa  73.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  20.78 
 
 		 1058 aa  73.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  24.68 
 
 		 908 aa  68.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  25.16 
 
 		 746 aa  67.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  21.45 
 
 		 1170 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  24.21 
 
 		 562 aa  66.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1177 aa  66.2  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  23.72 
 
 		 1002 aa  65.9  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  24.47 
 
 		 557 aa  64.7  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  28.5 
 
 		 1306 aa  64.7  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  30.38 
 
 		 1338 aa  64.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1016 aa  64.3  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1125 aa  63.5  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1147 aa  63.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1209 aa  63.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  30.64 
 
 		 1358 aa  63.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1339 aa  63.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1333 aa  63.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.32 
 
 		 836 aa  62.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  29.63 
 
 		 1319 aa  62.4  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1422 aa  61.6  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  19.91 
 
 		 1426 aa  61.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1243 aa  60.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1120 aa  60.1  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  29.38 
 
 		 1321 aa  59.7  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  24.1 
 
 		 694 aa  60.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  23.02 
 
 		 1432 aa  59.7  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  29.32 
 
 		 1219 aa  60.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  26.01 
 
 		 974 aa  60.1  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  23 
 
 		 1154 aa  58.9  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1459 aa  58.5  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  27.52 
 
 		 1336 aa  57.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  27.45 
 
 		 919 aa  56.6  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  28.57 
 
 		 1322 aa  56.6  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  22.48 
 
 		 814 aa  56.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1231 aa  55.8  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1373 aa  55.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  28.38 
 
 		 792 aa  55.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  27.41 
 
 		 1331 aa  55.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  29.87 
 
 		 1322 aa  54.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  25.99 
 
 		 1712 aa  53.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1250 aa  53.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1250 aa  53.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4624  hypothetical protein  27.27 
 
 		 448 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977454 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  24.58 
 
 		 1041 aa  53.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  25.14 
 
 		 570 aa  52.4  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  30.25 
 
 		 1318 aa  52.4  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  26.82 
 
 		 795 aa  52.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  30.43 
 
 		 1055 aa  52  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1321 aa  52  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  39.74 
 
 		 1430 aa  51.6  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  26.83 
 
 		 410 aa  51.6  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1324 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  28.3 
 
 		 929 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  28.09 
 
 		 1355 aa  50.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  23.97 
 
 		 504 aa  50.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  31.01 
 
 		 1343 aa  50.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  27.96 
 
 		 1354 aa  50.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  29.68 
 
 		 1338 aa  50.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  21.53 
 
 		 1132 aa  50.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2384  hypothetical protein  27.38 
 
 		 732 aa  49.7  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  25.12 
 
 		 673 aa  50.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  24.79 
 
 		 518 aa  49.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  22.29 
 
 		 629 aa  49.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1093 aa  48.9  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  37.5 
 
 		 1144 aa  48.9  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  26.26 
 
 		 652 aa  48.9  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  25.85 
 
 		 1277 aa  48.5  0.0007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  22.15 
 
 		 489 aa  48.5  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  25.85 
 
 		 1278 aa  48.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  29.41 
 
 		 478 aa  47.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  22.8 
 
 		 498 aa  47.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  31.11 
 
 		 926 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  27.14 
 
 		 768 aa  47.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  19.95 
 
 		 1076 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  35.06 
 
 		 1219 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  29.68 
 
 		 1125 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  29.88 
 
 		 1441 aa  46.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  24.55 
 
 		 914 aa  46.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1425 aa  46.2  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  21.96 
 
 		 1257 aa  46.2  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  24.64 
 
 		 523 aa  46.2  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  22.56 
 
 		 815 aa  46.2  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  24.64 
 
 		 508 aa  45.4  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  30.3 
 
 		 493 aa  45.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  26.62 
 
 		 871 aa  44.7  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>