59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5513 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  45.73 
 
 		 955 aa  761    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  100 
 
 		 934 aa  1924    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  70.94 
 
 		 929 aa  1341    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  45.15 
 
 		 941 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  37.78 
 
 		 933 aa  534  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  37.43 
 
 		 908 aa  529  1e-148  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  35.81 
 
 		 909 aa  511  1e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  37.81 
 
 		 928 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  37.39 
 
 		 937 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  35.12 
 
 		 934 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  33.72 
 
 		 912 aa  456  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  35.34 
 
 		 914 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  34.06 
 
 		 916 aa  452  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  34.73 
 
 		 871 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  33.21 
 
 		 926 aa  426  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  32.64 
 
 		 926 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  33.29 
 
 		 928 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  31.88 
 
 		 918 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  32.09 
 
 		 919 aa  406  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  31.28 
 
 		 921 aa  392  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  30.86 
 
 		 928 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  30.84 
 
 		 909 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  31.27 
 
 		 932 aa  383  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  29.82 
 
 		 929 aa  343  7e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  29.82 
 
 		 622 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  25.48 
 
 		 925 aa  161  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  24.16 
 
 		 978 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  23.7 
 
 		 1186 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1184 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1018 aa  134  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  27.39 
 
 		 918 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  20.72 
 
 		 1151 aa  126  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1154 aa  121  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1188 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  25.42 
 
 		 621 aa  110  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  24.88 
 
 		 973 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1173 aa  107  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1170 aa  102  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  26.04 
 
 		 869 aa  90.9  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1321 aa  71.2  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1353 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1342 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  25 
 
 		 1243 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  23.26 
 
 		 694 aa  58.9  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1298 aa  50.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  25.44 
 
 		 536 aa  50.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1440 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  32.26 
 
 		 97 aa  48.9  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1339 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1339 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1125 aa  49.3  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  19.35 
 
 		 1036 aa  48.5  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  20.78 
 
 		 416 aa  48.5  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0727  hypothetical protein  52.27 
 
 		 46 aa  48.1  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0148628 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  23.31 
 
 		 974 aa  47.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1210 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  18.85 
 
 		 1154 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  25.16 
 
 		 1041 aa  45.8  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  24.4 
 
 		 490 aa  45.4  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>