83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2902 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  100 
 
 		 621 aa  1280    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  48.08 
 
 		 918 aa  558  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  42.12 
 
 		 973 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  41.88 
 
 		 925 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1151 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1154 aa  304  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  33.75 
 
 		 1170 aa  301  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1173 aa  299  9e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1018 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  29.07 
 
 		 1186 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  29.99 
 
 		 1188 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1184 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  27.97 
 
 		 978 aa  191  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  31.71 
 
 		 869 aa  164  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  27.36 
 
 		 908 aa  161  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  27.48 
 
 		 937 aa  153  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  23.79 
 
 		 909 aa  151  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  26.4 
 
 		 928 aa  143  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  29.86 
 
 		 871 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  25.76 
 
 		 912 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  29.17 
 
 		 914 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  25.47 
 
 		 933 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  27.6 
 
 		 932 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  27.66 
 
 		 928 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.04 
 
 		 918 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  24.5 
 
 		 934 aa  127  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  27.59 
 
 		 916 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  24.69 
 
 		 919 aa  124  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.56 
 
 		 929 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  26.75 
 
 		 926 aa  120  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  26.74 
 
 		 941 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.61 
 
 		 909 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  26.91 
 
 		 926 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  26.56 
 
 		 929 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  25.42 
 
 		 934 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  26.85 
 
 		 921 aa  110  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  27.32 
 
 		 928 aa  109  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.62 
 
 		 974 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  21.91 
 
 		 955 aa  97.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2486  hypothetical protein  38.4 
 
 		 123 aa  77.8  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.658764  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3224  hypothetical protein  28.24 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  22.2 
 
 		 1041 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1339 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1347 aa  60.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1298 aa  59.7  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1342 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1338 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  34.26 
 
 		 1339 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  34.26 
 
 		 1339 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  24.58 
 
 		 1432 aa  57.8  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1441 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1039 aa  56.2  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  34.51 
 
 		 1321 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1422 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  21.69 
 
 		 1343 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1346 aa  52.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  21.72 
 
 		 504 aa  51.6  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1243 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1184 aa  51.2  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  38.67 
 
 		 1347 aa  51.2  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25.75 
 
 		 950 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  24.89 
 
 		 1076 aa  50.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1250 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1250 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1440 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1461 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1359 aa  48.5  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1022 aa  47.4  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1409 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  28.91 
 
 		 536 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1333 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  24.63 
 
 		 1059 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  32.11 
 
 		 512 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1373 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1282 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1363 aa  45.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1093 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1452 aa  45.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1426 aa  44.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  44.3  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  20.08 
 
 		 995 aa  43.9  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  33.72 
 
 		 1338 aa  43.9  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  36.84 
 
 		 1318 aa  43.5  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>