71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4327 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  51.74 
 
 		 1173 aa  1194    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  58.66 
 
 		 1018 aa  1195    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  42.83 
 
 		 1184 aa  868    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  43.58 
 
 		 1186 aa  767    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  65.67 
 
 		 1154 aa  1540    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  44.3 
 
 		 1151 aa  988    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  100 
 
 		 1170 aa  2384    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  42.95 
 
 		 1188 aa  913    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  42.46 
 
 		 869 aa  668    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  32.36 
 
 		 918 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  31.94 
 
 		 973 aa  396  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  29.54 
 
 		 925 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  34.02 
 
 		 621 aa  307  8.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  40.86 
 
 		 430 aa  275  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  25.44 
 
 		 978 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3224  hypothetical protein  40.64 
 
 		 332 aa  201  7.999999999999999e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  22.08 
 
 		 909 aa  168  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1346 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  21.98 
 
 		 908 aa  157  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  22.11 
 
 		 934 aa  157  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  20.85 
 
 		 912 aa  146  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  22.4 
 
 		 919 aa  143  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1440 aa  141  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1409 aa  141  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1363 aa  140  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  22.41 
 
 		 933 aa  139  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1282 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1353 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1290 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  30 
 
 		 536 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  23.28 
 
 		 955 aa  133  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1365 aa  133  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  22.37 
 
 		 928 aa  132  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  25.88 
 
 		 916 aa  132  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1342 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  22.68 
 
 		 871 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1347 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  42.86 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1347 aa  127  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1366 aa  126  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1339 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1339 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  24.01 
 
 		 937 aa  122  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  23.45 
 
 		 914 aa  122  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  23.54 
 
 		 928 aa  122  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1441 aa  121  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  24.27 
 
 		 932 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.68 
 
 		 929 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1321 aa  115  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  22.82 
 
 		 934 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  21.16 
 
 		 918 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1243 aa  112  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.31 
 
 		 926 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  22.96 
 
 		 941 aa  106  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1461 aa  107  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  22.62 
 
 		 926 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  22.46 
 
 		 929 aa  104  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1452 aa  103  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  23.19 
 
 		 928 aa  98.2  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.96 
 
 		 909 aa  92.4  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  22.97 
 
 		 921 aa  89.4  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.41 
 
 		 974 aa  65.5  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  20.62 
 
 		 512 aa  57.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1426 aa  54.3  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1338 aa  52.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  22.19 
 
 		 1041 aa  50.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  24.62 
 
 		 1432 aa  48.5  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1184 aa  48.5  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  35.19 
 
 		 1359 aa  47  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1241 aa  47  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.58 
 
 		 950 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>