162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3351 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  50.61 
 
 		 1336 aa  1203    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  34.63 
 
 		 1321 aa  692    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  38.36 
 
 		 1319 aa  712    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  38.28 
 
 		 1318 aa  794    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  35.4 
 
 		 1322 aa  637    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  41.54 
 
 		 1339 aa  900    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  37.35 
 
 		 1354 aa  780    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  37.66 
 
 		 1343 aa  764    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  36.8 
 
 		 1459 aa  672    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  34.73 
 
 		 1358 aa  669    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  38.26 
 
 		 1306 aa  758    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  41.34 
 
 		 1373 aa  811    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  43.53 
 
 		 1422 aa  903    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  100 
 
 		 1338 aa  2699    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  38.16 
 
 		 1333 aa  776    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  34.77 
 
 		 1322 aa  661    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  35.12 
 
 		 1338 aa  698    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  36.71 
 
 		 1355 aa  750    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  37.74 
 
 		 1219 aa  622  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  35.93 
 
 		 1331 aa  598  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  39.41 
 
 		 1712 aa  592  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  36.92 
 
 		 1055 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  31.3 
 
 		 1442 aa  318  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  31.74 
 
 		 1282 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1290 aa  307  7e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1243 aa  299  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1250 aa  220  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  23.25 
 
 		 1277 aa  219  4e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1250 aa  213  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1581 aa  210  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.87 
 
 		 1432 aa  209  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  22.72 
 
 		 1278 aa  201  7e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1332 aa  174  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1612 aa  169  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  32.4 
 
 		 1461 aa  161  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1098 aa  161  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1426 aa  158  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1349 aa  148  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  32.19 
 
 		 1452 aa  145  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1409 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  33.23 
 
 		 1339 aa  139  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  33.23 
 
 		 1339 aa  139  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1441 aa  138  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1321 aa  138  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1375 aa  133  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1353 aa  134  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1022 aa  131  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  33.15 
 
 		 1363 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  26.18 
 
 		 974 aa  128  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1342 aa  125  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1575 aa  125  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1640 aa  125  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  23.3 
 
 		 826 aa  124  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  32.13 
 
 		 1365 aa  124  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  32.88 
 
 		 846 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.33 
 
 		 1640 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1642 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  26.68 
 
 		 1557 aa  122  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  28.41 
 
 		 1573 aa  120  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1366 aa  120  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1644 aa  119  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1546 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1572 aa  115  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1709 aa  112  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1579 aa  112  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  40.49 
 
 		 1347 aa  111  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  25.38 
 
 		 1581 aa  108  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  40.82 
 
 		 1347 aa  107  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  35.05 
 
 		 1751 aa  105  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  40 
 
 		 1346 aa  105  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  22.98 
 
 		 1041 aa  102  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  39.43 
 
 		 1440 aa  102  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1298 aa  93.6  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.38 
 
 		 1076 aa  86.7  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1177 aa  81.6  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1154 aa  80.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1178 aa  79.3  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1184 aa  79.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1338 aa  78.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  22.86 
 
 		 1244 aa  77  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1209 aa  77  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  32.31 
 
 		 795 aa  76.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  20.55 
 
 		 1089 aa  76.3  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.53 
 
 		 995 aa  75.5  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  31.95 
 
 		 1132 aa  74.7  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  29.29 
 
 		 950 aa  73.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  26.2 
 
 		 1159 aa  72.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.95 
 
 		 1058 aa  72.4  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1210 aa  70.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1039 aa  70.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  27.39 
 
 		 838 aa  70.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  25.85 
 
 		 1186 aa  70.5  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  24.62 
 
 		 1252 aa  69.7  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1036 aa  68.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  25.13 
 
 		 1257 aa  68.6  0.0000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1104 aa  68.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  24.06 
 
 		 1020 aa  67.4  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  29.41 
 
 		 1038 aa  64.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  34.51 
 
 		 1170 aa  64.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1120 aa  64.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>