150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1603 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  100 
 
 
1170 aa  2424    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  35.29 
 
 
1120 aa  632  1e-179  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  35.76 
 
 
1147 aa  625  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  33.85 
 
 
1177 aa  600  1e-170  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  39.43 
 
 
1178 aa  545  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  36.66 
 
 
1159 aa  322  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  31.12 
 
 
1089 aa  298  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  25.16 
 
 
1154 aa  225  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  24.35 
 
 
1076 aa  216  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  23.02 
 
 
1338 aa  204  8e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  22.52 
 
 
1132 aa  182  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  22.22 
 
 
1209 aa  151  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  23.63 
 
 
838 aa  132  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  23.4 
 
 
882 aa  132  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.97 
 
 
995 aa  131  7.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  23.72 
 
 
1426 aa  131  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.97 
 
 
1194 aa  130  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  28.54 
 
 
1039 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  24.85 
 
 
1104 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  23.5 
 
 
1184 aa  128  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  35.61 
 
 
1210 aa  127  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  25.73 
 
 
1088 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  23.29 
 
 
1036 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  22.28 
 
 
1256 aa  109  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  22.28 
 
 
1299 aa  108  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  26.11 
 
 
404 aa  100  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  24.71 
 
 
1041 aa  100  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.53 
 
 
950 aa  99.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  24.9 
 
 
1257 aa  96.7  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.91 
 
 
974 aa  94  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  25.98 
 
 
1244 aa  92.8  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.08 
 
 
1020 aa  90.5  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  24.24 
 
 
1252 aa  90.5  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  30.04 
 
 
1298 aa  87.8  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.81 
 
 
1058 aa  86.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.87 
 
 
836 aa  85.5  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  22.11 
 
 
1432 aa  81.6  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  27.03 
 
 
795 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  34.43 
 
 
493 aa  71.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  31.47 
 
 
792 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  32.31 
 
 
1343 aa  70.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  24.1 
 
 
1125 aa  70.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  23.53 
 
 
416 aa  69.7  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  19.89 
 
 
652 aa  68.2  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  30.86 
 
 
846 aa  67.4  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  21.45 
 
 
1189 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  27.57 
 
 
523 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  21.37 
 
 
1612 aa  67.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  21.66 
 
 
1321 aa  65.1  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  34.62 
 
 
1452 aa  65.1  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  36.3 
 
 
1712 aa  65.1  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  23.14 
 
 
1167 aa  64.7  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  23.26 
 
 
684 aa  64.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  34.51 
 
 
1338 aa  63.9  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  37.96 
 
 
1339 aa  63.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  25.61 
 
 
1055 aa  63.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  28.67 
 
 
1186 aa  63.2  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  28.76 
 
 
410 aa  63.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  31.47 
 
 
1333 aa  63.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  33.58 
 
 
1306 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  20.31 
 
 
1342 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  30.86 
 
 
1461 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  36.84 
 
 
1318 aa  61.6  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  35.09 
 
 
1422 aa  61.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  31.67 
 
 
1354 aa  60.1  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  33.94 
 
 
1373 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  32.54 
 
 
1441 aa  58.9  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  22.56 
 
 
629 aa  58.9  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  32.06 
 
 
1331 aa  58.9  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  28.57 
 
 
1751 aa  58.9  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  34.29 
 
 
1338 aa  58.9  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  30.48 
 
 
1319 aa  58.5  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  19.57 
 
 
1277 aa  57.8  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  23.77 
 
 
1182 aa  56.6  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  24.56 
 
 
746 aa  56.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  34.78 
 
 
1243 aa  56.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  35.96 
 
 
1353 aa  56.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  21.13 
 
 
1278 aa  55.8  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  22.52 
 
 
527 aa  55.5  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  25.79 
 
 
673 aa  55.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  25.42 
 
 
389 aa  55.1  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  20.77 
 
 
1233 aa  55.1  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  32.35 
 
 
816 aa  55.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  23.57 
 
 
1195 aa  55.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  30.99 
 
 
1358 aa  55.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  21.25 
 
 
1222 aa  54.3  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  18.05 
 
 
518 aa  54.3  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  37.38 
 
 
1347 aa  54.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  22.43 
 
 
1218 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  31.9 
 
 
1425 aa  52.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  29.53 
 
 
1336 aa  52.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  36.45 
 
 
1219 aa  52.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  23.08 
 
 
1239 aa  52.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  28.99 
 
 
1339 aa  52.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  21.72 
 
 
1144 aa  52.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  28.99 
 
 
1339 aa  52.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  21.15 
 
 
1209 aa  52  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  34.23 
 
 
1322 aa  52.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  22.46 
 
 
612 aa  51.6  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  26.75 
 
 
1282 aa  51.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>